В 1774 г. при церкви преподобного Ксенофонта был устроен придел в честь Сошествия Святого Духа на апостолов. 7 октября 1798 г. престол преподобного Ксенофонта был перенесён в трапезную Сергиевскую церковь как придельный. Тогда же там был устроен придел во имя святых Афанасия и Гликерии. Ксенофонтов храм был переосвящён в Свято-Духовский (устроенный в 1774 г. придел стал основным алтарём). В 1806 г. к трапезной Сергиевской церкви был пристроен придел святых Валентина и Пасикрата. В 1819 г. Знаменская церковь над восточными вратами была переосвящена в честь Тихвинской иконы Божьей Матери. В 1831 г. Тихвинский престол был перенесён в трапезную церковь в качестве основного алтаря, а Сергиевский престол временно упразднён. В 1834 г. церковь над восточными вратами была кардинально перестроена в стиле позднего ампира Евграфом Дмитриевичем Тюриным и переосвящена во имя Николая Чудотворца. Тогда же к ней присоединили кельи. В 1834–1845 гг. к Успенскому собору были пристроены палатка для ризницы и придел в честь Казанской иконы Божьей Матери. В 1839/1340 г. площадь трапезного храма расширилась благодаря приделам святых Валентина, Параскевы, Василия Блаженного (вместо сломанного тогда же придела святых Валентина и Пасикрата) и преподобного Сергия Радонежского (освящён в 1843 г.). Наиболее знаменательным событием того времени было возведение в 1835–1844 гг. по проекту Константина Андреевича Тона колокольни с храмом во имя святителя Иоанна, патриарха Константинопольского, и князя Александра Невского – одного из наиболее высоких зданий в Москве. При её возведении была снесена церковь-колокольня 1540 гг. (уже больше ста лет существовавшая без престола) и частично разобраны больничные кельи в северной части монастыря. В 1853 г. Свято-Духовская церковь была переосвящена во имя преподобного Александра Свирского. Таким образом, в середине XIX в. в монастыре были следующие храмы и престолы: Успенский собор с приделом Казанской иконы Божьей Матери; трапезная Тихвинская церковь с четырьмя приделами: святых Валентина, Параскевы и Василия Блаженного; преподобного Сергия Радонежского; святых Афанасия и Гликерии; святых Ксенофонта и Марии; церковь Происхождения Честных Древ над западными вратами; Никольская церковь над восточными вратами; церковь преподобного Александра Свирского у северной ограды; церковь Константинопольского патриарха Иоанна и святого Александра Невского в колокольне. Такая система престолов не менялась до упразднения монастыря (после 1917 г.). В первой половине XIX в. строительство в Московском Симоновом монастыре велось, в основном, за счёт средств частных жертвователей, что вело к смене престолов в перестраиваемых храмах. Ктиторы были заинтересованы в том, чтобы возводимый или ремонтируемый ими храм имел посвящение соимённым им (или их близким) святым. Многие сооружения монастыря были первоклассными памятниками архитектуры (Успенский собор, церковь Всемилостивого Спаса, 1593 г.; крепостная ограда 1640 гг.; трапезная конца XVII в.; колокольня XIX в.), что указывает на авторитет обители и свидетельствует о высоком художественном вкусе её настоятелей и братии.