Арабская надпись на воротах 1227 г. была опубликована Иоганном Гильдемейстером и Максом ван Берхемом в 1887–1888 гг. В 1877 г. Горацио Герберт Китченер описал разрушенный грот, сделал обмеры искусственной пещеры и ниш, упомянул стены с кладкой opus reticulatum, полы с мозаиками и мраморной облицовкой («дворцовая» терраса, позже раскопанная Эхудом Нетцером). В самом городе Г.Г. Китченер отметил серию римских арок. Он также опубликовал рисунок дорического фриза с розеттами. Средневековые укрепления, которые, как ему казалось, относились ко времени крестоносцев, были асимметричными в плане, включали три башни и ворота; по внешнему периметру крепость была окружена оврагами. В ходе арабо-израильской войны 1967 г. район Кесарии Филипповой был оккупирован Израилем. Здесь были начаты систематические археологические исследования Кесарии Филипповой под руководством Я. Олами. Были идентифицированы римские термы рядом с западным берегом Нахаль-Хермона. Термы были построены из крупных каменных квадров, опирались на арки, их стены были расписаны фресками (в настоящее время целиком засыпаны). В западной части города были раскрыты мозаичные полы и фрагмент базальтовой скульптуры римского орла. Из средневековых сооружений были обнаружены девять башен, мечеть в помещении южных ворот, керамика, монеты, надписи. В 1968 г. овраг вдоль восточной стены был вычищен, локализованы ещё три башни; были обнаружены остатки глиняных сосудов для «греческого огня». В 1970 г. А. Грабуа опубликовал детальное описание укреплений XII в. с зарисовками планов башен. В 1973 г., во время строительных работ, в соседнем кибуце Снир были открыты римские могилы (исследованы Д. Амиром). В 1974 г. Д. Амир изучал также остатки сельскохозяйственных устройств и сооружений III в. н.э. В 1977–1978 гг. Э. Нетцер при содействии Еврейского университета в Иерусалиме сделал несколько археологических проб в кладке стен opus reticulatum. В 1982 г. Меир Бен-Дов также брал пробы из стен фортификационных сооружений. В 1983–1985 гг. М. Харталь проводил систематическое исследование всей территории; открыл ещё один городской квартал, акведук, кладбище. По его наблюдениям, до римского периода в Кесарии Филипповой не было поселений. В 1984 г. М. Харталь и Ц. Маоз открыли часть римской виллы. В 1985 г. Василиос Цаферис при содействии Министерства древностей и музеев Израиля вёл раскопки на территории к северу от северо-восточной башни. Были открыты дополнительные сельскохозяйственные сооружения мамлюкского периода. С 1988 г. в Кесарии Филипповой проводились систематические раскопки в районах святилища Пана (Ц. Маоз) и городского центра (В. Цаферис).