В 403 г. поместный Собор открылся 25 августа в Карфагене, в базилике второго региона (basilica regionis secundae). Участники обсуждали вопросы, связанные с отсутствием достаточного числа представителей, в том числе из отдалённых провинций – Цезарейской Мавритании и Триполитании. Основные решения Собора посвящены проблеме донатистского раскола, для искоренения которого следовало помимо прочего приглашать донатистов на публичные дебаты при посредстве местных магистратов. Каждый епископ самостоятельно или в сотрудничестве с соседними епископами должен был связаться с донатистскими епископами и привлечь их к дискуссии с участием совета старейшин (seniores locorum) и магистратов. Аврелий составил письма к местным властям с просьбой о содействии, а также послание к донатистам с предложением направить представителей для обсуждения возможностей преодоления раскола. Участники следующего Собора, который состоялся 16 июня 404 г. в Карфагене, в базилике второго региона, констатировали неудачу попытки привлечь донатистов к дискуссии. В Равенну к императору Гонорию была направлена делегация с просьбами о защите православного духовенства от насилия схизматиков и о применении к донатистам законов, направленных против еретиков, в том числе закона императора Феодосия I Великого от 15 июня 392 г. против еретиков, совершавших рукоположения, и закона от 8 мая 381 г. о лишении манихеев прав завещания, наследования и дарения. Прошение императору от имени всех африканских православных епископов направил Аврелий Карфагенский, который также составил послание к судьям с просьбой защищать членов православной церкви от насилия донатистов. Инициатором этих мер, ставивших донатистский раскол вне закона, но исключавших применение физических наказаний, выступил Августин Блаженный. Император Гонорий, которому представили избитого донатистами Максимиана, епископа Багаи, был убеждён в необходимости введения жёстких мер для установления церковного единства в Африке. В декабре 405 г. были изданы указы о применении к донатистам законов, относившихся к еретикам. Участники Собора, который проходил в Карфагене 23 августа 405 г., направили к императору делегацию с благодарностью за принятые меры. Они отметили, что в Карфагене церковное единство восстановлено, и составили письма к должностным лицам в других городах с просьбой ускорить выполнение императорских указов. Епископы также напомнили о необходимости направлять на Соборы полномочных представителей всех провинций Африки. Было зачитано и одобрено послание Римского епископа Иннокентия I, в котором запрещалось африканским православным епископам без необходимости обращаться к императорскому двору или к Римскому престолу (ad transmarina pergere). Следующий поместный Собор открылся 13 июня 407 г. в Карфагене, в базилике второго региона. Указывая на то, что постановление «Гиппонского бревиария» о ежегодном проведении Соборов исполнять затруднительно, епископы приняли решение о созыве поместных Соборов при возникновении необходимости и о рассмотрении вопросов местного значения на провинциальных Соборах.