Страдания Христа начались ещё до крестной Жертвы, когда он добровольно понёс на Себе «скорбь естества». «Не иначе восхотел спасти Горшечник погибающую глину, но только так, что Сам вознамерился пребывать с ней». Спасение представлено как победа над врагом рода человеческого, плоды которой доступны как иудеям, так и язычникам. От вознесения Христа до всеобщего воскресения спасение людей совершается в церкви. «Церковь из язычников» заняла место «синагоги иудеев», которая «отдала назад свой брачный договор и собственными руками разодрала свой брачный хитон». Христианская церковь представлена как Новая Ева, вышедшая из ребра Христова. Ещё в Ветхом Завете она была прообразована в виде пустыни, которая некогда наполнится водой и зацветёт. Христос есть «лицо церкви». Церковь получает от Него свет, как луна от солнца. Церковь есть здание и укреплённый город, построенный Богом и ангелами, и никакие еретики не смогут разрушить его. Время существования церкви рассматривается Исихием Иерусалимским как длинный путь и как время ожидания конца мира и всеобщего воскресения. Преподаваемое в церкви крещение есть таинство, прообразованное и предсказанное ещё пророками. Погружаясь в Иордан, Христос освятил его воды и установил таинство крещения, с которым связано и таинство слёз, т.е. покаяние: «Ибо слёзы покаяния есть следствие дара крещения…, тот, кто не принимает крещения, напрасно кается, если он не прибегнет к крещению, напрасно приносит молитву, напрасно испрашивает прощение, напрасно изливает слёзы. Ибо без крещения не совершается отпущение грехов. Тот же, кто крестился, стяжал деятельное покаяние: плачет – и он освобождён, стенает, сокрушается и молится – и тотчас очищается». Дары крещения проявляются не только в прощении грехов, но и в усвоении человеком смерти и воскресения Христа; оно делает человека причастником действия Святого Духа, которое преобразило воду в обиталище Бога, а нас – в чад Божьих. Как Христос был предвечно помазан Святым Духом, так и новокрещённый христианин помазуется святым елеем и с этого момента считается членом церкви. Церкви вверено таинство покаяния как некое «лекарство», исцеляющее человека от душевной смерти, если он признает и исповедует свои грехи и недостатки, как больной – врачу. Такое исповедание есть результат смирения, которое не только дарует отпущение грехов, но и даёт человеку надежду стать причастником будущих благ. Таинство евхаристии также было прообразовано в Ветхом Завете в виде манны. Причастие Телу и Крови Христа, впервые произошедшее в Сионской горнице, продолжается в церкви. В евхаристии церковь предлагает верным «божественный пир», «животворящего Агнца», «таинственную трапезу», «насущный хлеб». Евхаристия – это Христос, ставший Хлебом и Чашей жизни, причащаться евхаристии – значит причащаться Христа. Кто не причащается, тот слаб и беден, кто причащается, тот силён, радостен и составляет Тело Христово. Значительное число фрагментов из библейских комментариев Исихия Иерусалимского вошло в состав экзегетических катен, многие из которых остаются неизданными.