В середине июля 1867 г. был закрыт костёл большого прихода в местечке Ляховичи Слуцкого уезда. Капитальный ремонт здания был произведён за несколько недель, от имени императора в переделанный храм придворный протопресвитер Василий Борисович Бажанов прислал образ Спасителя. Богослужение возглавил Михаил в присутствии минского губернатора Павла Никаноровича Шелгунова. Михаил совершал и поездки по епархии (например, 1–4 мая 1860 г. с целью знакомства с приходами Борисовского уезда посетил Косинскую, Логойские и Плещеницкую церкви). В эпоху реформ 1860 гг. в ряде епархий были образованы благочиннические советы. В 1865 г. Михаил впервые собрал благочинных своей епархии для обсуждения вопросов религиозного воспитания и нравственности. Его примеру последовали другие правящие архиереи. Михаил устраивал «соборики» духовенства во главе с благочинными. Первый такой «соборик» состоялся в квартире минского благочинного священника Никанора Смолича 13 декабря 1865 г. Они начинались с соборного церковного богослужения, затем проводилось заседание. В конце духовенство совершало панихиду по усопшим родственникам хозяев дома, в котором проходило собрание. 18 апреля 1865 г. при минском кафедральном Петропавловском соборе было учреждено братство, получившее наименование Николаевского в память о цесаревиче Николае Александровиче. Своими задачами оно ставило заботу о процветании православной веры, повсеместное учреждение при церквах школ, содействие церковному благолепию и расширение сферы благотворительности. Первое общее собрание братства прошло в нововозведённом доме Михаила. Он, в частности, предлагал обсудить возможность проведения воскресных уроков для обучения православных женщин (преимущественно из прислуги) правилам веры и нравственности. 31 декабря 1867 г. открылось ещё одно, Преображенско-Николаевское Слуцкое братство. С 1868 г. издавались «Минские епархиальные ведомости» – официальный епархиальный печатный орган. Михаил часто бывал в Антониевой пустыни – деревянной даче-ферме на реке Свислочь, устроенной в 1847–1848 гг. его предшественником архиепископом Антонием (Зубко) на средства Синода. Он создал при ней и церковь во имя своего небесного покровителя – преподобного Антония Киево-Печерского (архитектор Вылежинский). С 1865 г. пустынь стала официальной летней резиденцией Минских архиереев. Постоянным насельником был игумен Арсений (Короткевич), с 1843 г. – духовник Минского архиерейского дома и Минских архиереев Антония (Зубко), Михаила и Александра (Добрынина). Михаил подолгу жил там в летнее время, развёл сад, цветник, в котором особенно выделялись посадки георгинов, огород с парниками. Резиденцию посещали минские губернаторы граф Эдуард Фёдорович Келер и П.Н. Шелгунов, епископ Ковенский Филарет (Малышевский), епископ Адам Войткевич, управляющий Минской палатой государственных имуществ В.Д. Севастьянов, генерал-лейтенант Иван Евстафьевич Штаден, генерал-майоры П.М. Мейер и М.И. Пущин, доктор медицины и профессор Медико-хирургической академии в Санкт-Петербурге Генрих Казимирович Кулаковский, главный врач Минского военного госпиталя Пётр Семёнович Топорнин, первый директор народных училищ Минской губернии Александр Андреевич Кандидов, губернский архитектор М.К. Хрищанович, статский советник М.И. Казаринов (впоследствии минский городской голова), издатель и публицист Иван Онисимович Эремич, владелец соседнего Лошицкого имения губернский предводитель дворянства Евстафий Станиславович Прошинский и др.