При Михаиле было устроено значительное количество церквей. В Минске по его инициативе была построена в стиле классицизма церковь во имя равноапостольной Марии Магдалины на Сторожевском кладбище (ул. Киселёва). В 1845–1852 гг. Михаил освятил церковь во имя Николая Чудотворца, сооружённую на средства помещика И. Хмары близ Хмарина Городка (деревня Чучаны). 15 августа 1858 г. освятил Никольскую церковь в селе Станькове (современный Дзержинский район Минской области), построенную владельцем местной усадьбы графом Эмериком фон Гуттен-Чапским (в 2017 г. восстанавливалась из руин). В 1860 г. в Минске Михаил начал возведение двухэтажного каменного архиерейского дома с Покровской церковью (строился при участии архитектора В.Э. Вылежинского; не сохранилась). В том же году посетил приход деревни Швабовка (Гать) и дал распоряжение о строительстве нового храма, которое началось в 1863 г. 18 марта 1867 г. по благословению Михаила храм был освящён, как и прежний, в честь Рождества Пресвятой Богородицы. 8 ноября 1861 г. была освящена Избицкая каплица, 9 мая 1863 г. – Михайловская каплица в деревне Мгле, «в память свободы христиан» (после капитального ремонта и перестройки в церковь по благословению архиепископа). Сооружение православных церквей интенсифицировалось в пореформенный период и после событий 1863 г. Возведение храмов и перестройка их из костёлов велись преимущественно на правительственные средства, а также на пожертвования частных лиц, прежде всего, москвича И.И. Четверикова. Для заведования церковным строительством был учреждён особый комитет. В 1860 гг. в Минской епархии было возведено около двадцати каменных и до 70 деревянных храмов и ещё больше перестроено. «Упразднено 5 католических монастырей и несколько десятков приписных костелов», – писал Михаил 14 июня 1865 г. епископу Игнатию. «За всем тем католическая пропаганда не уменьшилась, а только стала осторожнее». При Михаиле была прекращена деятельность Илиинского женского монастыря города Слуцка. В 1866 г. был упразднён и обращён в православную приходскую церковь костёл Хмарина Городка. 30 октября того же года Михаил освятил храм в честь Рождества Пресвятой Богородицы. После польского восстания 1863 г. был ликвидирован католический приход в Гайне, его земельное имущество перешло в казну, бывший Успенский костёл передан православному приходу и 16 октября 1867 г. освящён Михаилом как православная церковь в честь Успения Пресвятой Богородицы. Архиерей посещал Гайненский приход и раньше. 11 июля 1855 г. наблюдал за тем, как настоятель прихода, Адам Самкович, служит обедню и молебен, после чего Михаил вызвал его в Минск, где тот был вынужден неделю практиковаться в кафедральном соборе. В деревне Паперня в 1865 г. был разобран Троицкий храм, вместо него построен новый, деревянный – в стиле народного зодчества, который освятили во имя архангела Михаила. На Рыночной площади города Слонима на месте сгоревшего католического монастыря М.В. Сильвестров предложил построить часовню в память «воинов и всех честных граждан, погибших во время мятежа». 3 сентября 1868 г. Михаил совершил освящение часовни и отслужил панихиду. 4 сентября 1868 г. освятил каменную церковь апостолов Петра и Павла в деревне Мизгири.