По утверждению Михаила Пселла, его отношения с Романом IV Диогеном не сложились: император относился к нему подозрительно и брал с собой в военные походы, чтобы держать его под присмотром вдали от столицы. Однако исследователи допускают, что указания Михаила Пселла в «Хронографии» на вражду с Романом IV Диогеном были предназначены для того, чтобы отмежеваться от императора, потерпевшего поражение в 1071 г. и лишённого власти и жизни Дуками. Так или иначе, но при Романе IV Диогене Михаил Пселл по-прежнему играл видную роль в политической жизни Константинополя, формально сохраняя своё положение в числе регентов юных Михаила и Константина Дук. Осенью 1071 г., после разгрома и пленения Романа IV Диогена тюрками-сельджуками, Михаил Пселл становится одним из главных сторонников восстановления самостоятельного правления Дук. Он участвует в перевороте в Константинополе, в ходе которого на престол был возведён император Михаил VII Дука (1071–1078 гг.). Летом 1072 г. Роман IV Диоген оказался в руках Дук и, как полагают исследователи, не без совета Михаила Пселла, был ослеплён, когда под конвоем направлялся из Киликии в Константинополь; спустя месяц он умер. Во время этих событий Михаил Пселл написал Роману IV Диогену утешительное послание (это сочинение исследователи признали образцом беспринципности и изворотливости Михаила Пселла как политика). До середины 1070 гг. он оставался при дворе советником императора Михаила VII Дуки, продолжал учёные занятия и организовывал диспуты с представителями правящей семьи. Дальнейшая судьба Михаила Пселла остаётся для исследователей во многом неизвестной. Последние события, упомянутые им в «Хронографии», относятся к 1074–1075 гг. К этим же годам относятся последние точно датируемые сочинения Михаила Пселла: гомилия «О чуде во Влахернах» и «Монодия на смерть патриарха Иоанна Ксифилина». После середины 1070 гг. о жизни и работах Михаила Пселла достоверных сведений почти не сохранилось. Византийская писательница Анна Комнина (середина XII в.) упоминает, что в конце жизни Михаил Пселл покинул Константинополь. Письма Михаила Пселла братьям Константину и Никифору Кирулариям были написаны за пределами столицы. В то же время, по мнению Якова Николаевича Любарского, такие поздние сочинения Михаила Пселла, как энкомии Константину Лихуду и Иоанну Мавроподу, были написаны в Константинополе после 1075 г., а монодия митрополиту Никифору Эфесскому – не раньше 1078 г. Дата смерти Михаила Пселла остаётся предметом напряжённых споров среди исследователей. Среди них есть сторонники ранних датировок – между 1076 и 1078 гг., и авторы, указывающие на 1090 гг. В «Истории» Михаила Атталиата (конец XI в.) дважды упоминается некий Михаил из Никомидии, который занимал пост ипертима и который умер около 1078 г. Раньше некоторые исследователи были склонны отождествлять его с Михаилом Пселлом, однако в настояще время большинством учёных эта гипотеза отвергнута, но среди западных специалистов мнение о ранней датировке смерти Михаила Пселла преобладает. В российской науке более предпочтительным считается мнение Я.Н. Любарского о смерти Михаила Пселла в конце 1090 гг.