Древнейшие материалы епархиального архива до начала XVI в. не сохранились, погибли, как полагают исследователи, в Смутное время в начале XVII в. Более поздние документы по истории Коломенской епархии отложились в Российском государственном архиве древних актов, Центральном государственном историческом архиве Москвы и Государственном архиве Тульской области, в Российском государственном историческом архиве (Санкт-Петербург) хранится переписка Коломенских епископов со Святейшим Синодом. Архиерейская школа была открыта в Коломне в 1723 г. в доме епископа. Обучение велось по составленному архиепископом Феофаном (Прокоповичем) первому русскому учебнику Закона Божия – «Букварь, или Первое учение отроком с Катехизисом», в курс обучения также входили славянский букварь и «элементарий латинский». Первым преподавателем в школе стал певчий Я. Иванов. К 1725 г. в школе прошли обучение 30 человек. 18 декабря 1724 г. трое учеников Коломенской школы (священнические дети П. Георгиев и Г. Михайлов и сын диакона И. Михайлов) были направлены в Новгород «для обучения славянской грамматике». В 1727 г. они окончили курс и указом Коломенского епископа Варлаама (Леницкого) были назначены учителями в славянские школы Коломенской епархии, располагавшиеся в Коломне, Туле (в Иоанно-Предтеченском монастыре) и Орле (в Успенском монастыре). Исследователи полагают, что две последние школы были открыты после приезда учителей. В 1725–1727 гг. в трёх школах в Коломенской епархии обучались 120 человек. Состав учеников не был стабильным. Нередко ученики, производившиеся в низшие степени церковного клира – дьячки, пономари, иподиаконы (подиаки) – оставляли обучение. В 1727 г. в Коломенской епархии обучались 99 человек: в Коломне – 40 человек, в Туле – 34, в Орле – 25 человек. Из 150 человек, прошедших обучение в 1723–1727 гг., в дьячки и пономари были произведены 40 человек, в иподиаконы – 11 человек. В 1724 г. Коломенский архиерей доносил в Синод, что за недостатком средств ему не на что содержать школу и школьников. По «Духовному регламенту», на нужды школ необходимо было выделять 20-ю часть всех хлебных сборов «знатнейших в епархии монастырей» и 30-ю часть сборов с остальных церковных земель. По указу епископа Варлаама коломенские монастыри Спасский и Голутвинский были освобождены от отчислений в пользу духовной школы, поскольку их братия сама испытывала нужду. Тридцатая часть хлебных сборов с церковных земель была заменена натуральным и денежным сбором с каждой церкви в размере трёх четвериков хлеба. По мнению исследователей, из-за недостатка средств Коломенская архиерейская школа после 1727 г. закрылась, была возобновлена как семинария в 1731 г. (после императорских указов об учреждении школ согласно «Духовному регламенту» (1730 г.) и об открытии школ во всех епархиальных центрах и иных городах (1731 г.)). В 1731 г. на должность учителя был определён певчий архиерейского дома П. Григорьев. Управители Коломенского архиерейского дома писали епископу Вениамину о необходимости ходатайствовать в канцелярию Московского Синодального правления о присылке учителя из московского Заиконоспасского училищного монастыря, т.к. учащиеся Коломенской школы обучаются «только букварям, да чтению книг и пению, а вышним наукам по латыне и прочему, как указами повелено, обучать их некому». В 1733 г. по указу Синода для преподавания высших наук в Коломенскую школу был направлен выпускник Московской духовной академии И. Кузьмин. Из Заиконоспасского монастыря был прислан иеродиакон Зосима, который 28 февраля 1739 г. был утверждён в должности учителя Коломенской архиерейской школы и экзаменатора для ставленников.