В данном случае перевод выпускника Московской духовной академии в Санкт-Петербургскую духовную академию, а также особая забота совета академии об отправке М.И. Каринского в заграничную командировку свидетельствовали о выдающихся его способностях и познаниях в области философских дисциплин. С апреля 1871 г. по апрель 1872 г. М.И. Каринский занимался в университете Гейдельберга, где посещал лекции Эдуарда Целлера по психологии и философии права, Карла Александра фон Рейхлина-Мельдегга по эстетике и О. Каспари по истории материализма; в Йенском университете он слушал лекции Куно Фишера по истории древней философии и Карла Фортлаге по метафизике и логике и, наконец, в Гёттингенском университете посещал курсы Рудольфа Германа Лотце по логике и психологии и Ю. Бауманна по истории философии. После завершения заграничной командировки М.И. Каринский подал в совет академии отчёт «Критический обзор последнего периода германской философии», который представлял собой исследование по истории философии в Германии в первой половине – середне XIX в. Совет Санкт-Петербургской духовной академии постановил опубликовать отчёт за казённый счёт («Христианское чтение», 1873 г.). Его объём составил 333 страницы (отдельное издание: СПб., 1873 г.). В критическом обзоре немецкой философии М.И. Каринский сделал два главных вывода: решение вопросов метафизики невозможно без разрешения проблемы познания, но Кантово разрешение проблемы, которое определяло последний период философии, по мнению М.И. Каринского, научно несостоятельно. Следовательно, на первом плане в метафизике должны быть вопросы о самом познании. При отсутствии общепризнанной теории знания не хватает ни элементов для построения положительной системы метафизики, ни существенной научной основы. Поэтому задача преподавателя метафизики, по заключению М.И. Каринского, прежде всего, в критическом рассмотрении претендующих на научный характер решений метафизических проблем. 24 сентября 1873 г. М.И. Каринский был определён экстраординарным профессором Санкт-Петербургской духовной академии по кафедре метафизики, 13 мая 1874 г. перешёл на кафедру истории философии, которую до этого времени занимал И.А. Чистович. 7 апреля 1880 г. М.И. Каринский подал в совет Санкт-Петербургского университета прошение допустить его к защите диссертации «Классификация выводов» на соискание степени доктора философии. Рецензентами и оппонентами соискателя выступили профессор Михаил Иванович Владиславлев и доцент И.Б. Троицкий. По итогам защиты, состоявшейся 19 мая 1880 г., совет университета 30 мая единогласно удостоил М.И. Каринского степени доктора. 7 июня того же года М.И. Каринский был утверждён в звании ординарного профессора Санкт-Петербургской духовной академии. В курсе лекций М.И. Каринского, которые он читал в Санкт-Петербургской духовной академии, исследователи выделяют три основных раздела: древнюю философию, новую философию и курс истории философской этики; эти курсы он, как правило, читал поочерёдно. По воспоминаниям студентов, М.И. Каринский читал лекции без записей, «всецело погружаясь в процесс воссоздания и выяснения излагаемого философского учения и постепенно воодушевляясь. Речь Каринского отличалась большой выразительностью и стильностью: в веских и содержательных, точных и ясных положениях как будто вычеканивались со всею рельефностью специфические пункты излагаемой системы, а довольно большие периоды, которые так характерны вообще для слога Каринского, отличаясь внешней и внутренней соразмерностью, придавали этой речи своеобразную красоту».