В различные годы обитель посещали императрица Екатерина II (15 мая 1767 г.), великий князь Михаил Павлович (19–20 августа 1817 г.), император Николай I (7 октября 1834 г.), цесаревич Александр Николаевич, впоследствии император Александр II (14 мая 1837 г.), великие князья Николай и Михаил Николаевичи (8–9 августа 1850 г.), император Александр II c императрицей Марией Александровной (16 августа 1858 г.), наследник престола цесаревич Николай Александрович (30 июня и 1 июля 1863 г.), цесаревич Александр Александрович, впоследствии император Александр III (15 августа 1866 г.), великие князья Алексей Александрович и Алексей Михайлович (15 мая 1868 г.), великий князь Пётр Николаевич (11 июня 1879 г.). 22 июля 1881 г. император Александр III приехал в Ипатиевский монастырь вместе c императрице Марией Фёдоровной и наследником, цесаревичем Николаем Александровичем (впоследствии император Николай II). 14 мая 1898 г. обитель посетили московский генерал-губернатор великий князь Сергей Александрович, 8 июля 1902 г. – великий князь Константин Константинович, 3 июня 1908 г. – королева Греции Ольга Константиновна (1851–1926 гг.) с братом Константином Константиновичем и его детьми: Татианой, Иоанном, Гавриилом, Олегом и Игорем Константиновичами; 19 мая 1913 г. и 8 июля 1916 г. – великая княгиня Елизавета Фёдоровна. На рубеже XIX и XX вв. в Ипатиевском монастыре побывали: в мае 1862 г. Игнатий (Брянчанинов), 2 июня 1888 г. митрополит Сербский Михаил (Йованович), 19 июля 1897 г. и 30 сентября – 1 октября и 4–5 октября 1902 г. Иоанн Кронштадтский; неоднократно архиепископ Тихон (Беллавин). В начале XVIII в. в Ипатиевском монастыре пребывали «на исправлении» под надзором обвинённые в ереси братья иеромонахи Иоанникий и Софроний Лихуды, вызванные из Греции царём Фёдором Алексеевичем для основания в Москве Славяно-греко-латинской академии. Во время пребывания в Ипатиевском монастыре братья Лихуды составили греческую грамматику. Во второй половине XIX – начале XX вв. монастырь посещали писатели Василий Андреевич Жуковский, Александр Николаевич Островский, историки Михаил Петрович Погодин и Николай Иванович Костомаров, искусствовед Николай Васильевич Покровский, художники – братья Григорий Григорьевич и Никанор Григорьевич Чернецовы, Алексей Петрович Боголюбов, Николай Константинович Рерих, Василий Васильевич Верещагин, Пётр Иванович Петровичев и др. В 1909 г., когда в Костроме проходил четвёртый областной историко-археологический съезд, его участники посетили обитель. 24 июня, в честь 300-летия изгнания из Ипатиевского монастыря поляков и тушинцев, из монастыря к Святому озеру направился крестный ход, в котором приняли участие члены съезда, в том числе Алексей Иванович Соболевский, Фёдор Иванович Успенский, Николай Васильевич Покровский, Дмитрий Иванович Иловайский, Александр Александрович Титов, Владислав Крескентьевич Лукомский.