Вюртемберг и Бавария, хотя их епископы были на Исповедническом синоде в Бармене, не опубликовали текст Барменской декларации. Деятельность лютеран, склонных к компромиссу, была оценена как сближение с «немецкими христианами». Теологическим опровержением Барменской декларации стал меморандум «О церкви и вере» («Über Kirche und Bekenntniss»), составленный Йегером, лютеранскими теологами В. Штапелем и Э. Хиршем (доверенным лицом рейхсепископа) и направленный имперскому церковному правительству в июне 1934 г. Меморандум видел Откровение Господне в современном политическом порядке, который получал значение Царства Божия на земле. Йегер настаивал на образовании «единой, свободной от Рима национальной церкви» с присоединением католиков. Ситуация внутри церкви обострялась: 12 августа 1934 г. Братский совет Исповеднического фронта в Кафедральном послании ко всем земельным Братским советам объявил, что преданность действующему церковному правительству является изменой Богу, и призвал к отказу выполнять издаваемые им церковные законы, в особенности не принимать присягу фюреру. К. Барт утверждал, что клятва фюреру в отличие от клятвы кайзеру для христианина невозможна. Если раньше он воздерживался от политической оценки Третьего рейха, то летом 1934 г. писал К. Низелю, что «чем дольше это будет продолжаться, тем отчётливее немецкий народ будет понимать, что по своей наивности он весной 1933 г. пал жертвой грандиозного блефа, который много общего имеет с преступлением, но в любом случае это может закончиться катастрофой». Всё больше обострялись отношения нацистского режима с южными церквами – Баварской и Вюртембергской. Подчинить Майзера и Вурма не удалось: во второй половине августа 1934 г. они заявили о неприятии рейхскирхе и законов Национального синода, выразили солидарность с борющимися общинами, настаивали на легитимности исключительно Барменского синода. 3 сентября 1934 г. на совещании «немецкохристианских» епископов Л. Мюллер объявил Исповедническую церковь незаконной организацией, выступающей против христианской церкви немецкого народа, и распорядился соединить евангелические церкви Баварии, Вюртемберга, Ганновера в единую рейхскирхе. Епископы Вурм и Майзер были смещены с постов и взяты под домашний арест, церковные советы распущены, на место епископов были назначены «духовные» комиссары. Однако в результате протестов, давления международной общественности, особенно позиции Великобритании, церковное правительство было вынуждено снять Йегера со всех занимаемых должностей (26 октября 1934 г.). 20 ноября 1934 г. вышло распоряжение Л. Мюллера о возвращении земельных церквей в прежнее правовое состояние. Этому способствовали решения синода Исповеднической церкви, состоявшегося 19–20 октября 1934 г. в Далеме. Назначенный на 30 октября, он начал работу раньше из-за событий, происходивших в южных церквах. На синоде утверждалось, что насильственные действия церковных властей нарушили христианские основы, церковное право и Конституцию Немецкой Евангелической Церкви. Синод призвал своих сторонников игнорировать указания Л. Мюллера, отказываться от сотрудничества с теми, кто признают его церковное правительство.