Оттон I часто изымал у своих светских феодалов земли и отдавал их духовенству. Эти «оттоновские привилегии» позволяли ему самому назначать епископов в германских землях. Иоанн XII это понял и стал настраивать против Оттона I венгров, византийцев и даже сарацин. Это было уже явным нарушением договоренностей, и Оттон I подступил с войсками к Риму. Иоанн XII бежал, прихватив сокровища Ватикана. Под председательством Оттона I состоялся Собор, на котором Иоанн XII был низложен, а папой были избран Лев VIII (963–965 гг.), совершенно светский человек, рыцарь войска Оттона I. Однако с уходом Оттона I из Рима магнаты, стремившиеся к полной независимости и видевшие ее ограничение во вмешательстве императора в процесс избрания папы, взбунтовались. Этим воспользовался Иоанн XII и, низложив, прогнал Льва VIII. Со своими противниками он поступил так, как и следовало ожидать: многих замучил до смерти, некоторым выколол глаза, отрезал руки, пальцы, уши, носы и языки. Однако второй понтификат Иоанна XII длился недолго – 20 мая 964 г. его убил один из римских вельмож, жену которого Иоанн XII соблазнил. Римляне понимали, что теперь надо ждать кары Оттона I и принялись готовиться к защите. А папой избрали кардинала Бенедикта V (964–965 гг.). Оттон I не заставил себя долго ждать и вскоре осадил Рим, сломил сопротивление горожан и вновь восстановил на папском престоле Льва VIII, а Бенедикта V отправил в ссылку в Гамбург.

После смерти Льва VIII с согласия Оттона I папой избрали Иоанна XIII (965–972 гг.). Кстати, при учреждении пражского епископата в 967 г. он специальной буллой запретил привлечение священников из русского и болгарского народов и богослужения на славянском языке. Но этот папа, страдая манией величия, так восстановил против себя население Рима, что его изгнали. Почти год он провел в Капуе, нанял бандитов Калабрии, с их помощью вернулся в Рим и (с согласия Оттона I) устроил кровавую расправу над своими противниками. Конечно, его не могла миновать участь изверга – он был задушен в темнице.

Тем временем Оттон I все более стремился к окатоличиванию славян. Еще в 956 г. при Магдебургском епископстве были учреждены две новые епархии – для Польши и для Руси. В 962 г. учреждены еще три епархии, а в Магдебурге – архиепископство. Совместно с папой Иоанном XII он назначил русским епископом Адальберта, но киевляне быстро его изгнали, перебив всю свиту.

Сближение Польши и Германии относится к 965–966 гг., поэтому здесь без особых хлопот были организованы два архиепископства, семь епископств, множество аббатств. Король Мешко щедро одаривал католических миссионеров и Рим, расхищая несчастную Польшу.

В 967 г. Иоанн XIII издает буллу о тождестве христианских обрядов в русской и польской Церкви, что является прямым вмешательством в дела этих Церквей. В том же 967 г. открыта пражская епархия. Неизвестно, чем бы закончилась эта активность Оттона I, если бы он не умер от отравленной стрелы в бою за Калабрию с объединенными силами византийцев и сарацин в 973 г.