Патриарх также издаёт указы об избрании и назначении епархиальных архиереев, руководителей синодальных учреждений, викарных архиереев, ректоров духовных школ и иных должностных лиц, назначаемых Синодом. Он имеет попечение о своевременном замещении архиерейских кафедр; поручает архиереям временное управление епархиями в случае длительной болезни, кончины или нахождения под церковным судом епархиальных архиереев; наблюдает за выполнением архиереями их архипастырского долга по окормлению епархий; имеет право визитации – посещения в необходимых случаях всех епархий РПЦ; преподаёт архиереям братские советы как относительно их личной жизни, так и относительно исполнения ими архипастырского долга. Патриарх принимает жалобы на архиереев и даёт им ход; награждает архиереев установленными титулами и высшими церковными отличиями; награждает клириков и мирян церковными наградами; утверждает присуждение учёных степеней и званий; имеет попечение о своевременном изготовлении и освящении св. мира для общецерковных потребностей. Патриарх Московский и всея Руси является епархиальным архиереем Московской епархии, состоящей из города Москвы и Московской области. Патриарху в управлении Московской епархией помогает патриарший наместник на правах епархиального архиерея с титулом «митрополит Крутицкий и Коломенский». Патриарх Московский и всея Руси является священноархимандритом Свято-Троицкой Сергиевой лавры, ряда других монастырей и управляет всеми церковными ставропигиями. Образование ставропигиальных монастырей и подворий в Московской епархии осуществляется по указам Патриарха Московского и всея Руси. Образование ставропигий в пределах иных епархий осуществляется с согласия епархиального архиерея по решению Патриарха Московского и всея Руси и Священного Синода. Сан патриарха пожизненный. Право суда над патриархом, равно как и решение вопроса о его уходе на покой, принадлежит архиерейскому Собору (в Уставе 1988 г. – поместному Собору). На случай кончины патриарха, его ухода на покой или иной причины, делающей невозможным исполнение им патриаршей должности, Устав предусматривает институт местоблюстительства. Порядок избрания Местоблюстителя, в основном, повторяет порядок, указанный в Уставе 1988 г.: Священный Синод под председательством старейшего по хиротонии постоянного члена немедленно избирает Местоблюстителя Патриаршего престола из числа постоянных членов. В период междупатриаршества РПЦ управляет Синод под председательством Местоблюстителя; имя Местоблюстителя возносится за богослужениями во всех храмах РПЦ. Местоблюститель исполняет обязанности Патриарха Московского и всея Руси в полном объёме, за исключением права награждать архиереев титулами и высшими церковными отличиями.