Для избрания патриарха созывается Собор. Вопрос о созыве Собора ставит Священный Синод под председательством Местоблюстителя и определяет время созыва не позднее шести месяцев после освобождения Патриаршего престола. В «Положении» ничего не говорится о составе Собора. На Соборе 1945 г., принявшем «Положение», и на Соборе 1971 г. в избрании участвовали лишь епископы, которые, однако, голосовали не только от своего имени, но и от имени клира и мирян своих епархий. Местоблюститель, согласно «Положению» Собора 1945 г., не избирается: в эту должность должен вступать старейший по хиротонии постоянный член Священного Синода. Священный Синод, согласно «Положению» 1945 г., отличался от Синода, образованного в 1918 г., тем, что он не делил власть с Высшим Церковным советом и имел иной состав. Он состоял из председателя (патриарха), постоянных членов – митрополитов Киевского, Ленинградского и Крутицкого (архиерейский Собор 1961 г. расширил состав Священного Синода, включив в него в качестве постоянных членов управляющего делами Московской патриархии и председателя Отдела внешних церковных сношений). Три временных члена Синода вызывались поочерёдно на полугодовую сессию, согласно списку архиереев, по старшинству хиротонии. В год 1000-летнего юбилея Крещения Руси, когда в условиях кризиса советского режима во взаимоотношениях церкви и государства, а также церкви и официально признанных общественных структур обозначились существенные перемены, с 6 по 9 июля 1988 г. в Троице-Сергиевой лавре состоялся поместный Собор, который принял «Устав об управлении Русской Православной Церкви». Высшими органами церковной власти в соответствии с этим Уставом являются поместный Собор, архиерейский Собор и Священный Синод во главе с патриархом. Устав ввёл периодичность в созыв поместных Соборов, которые должны были впредь созываться патриархом (или в его отсутствие Местоблюстителем) и Священным Синодом по мере необходимости, но не реже одного раза в пять лет. В его состав вошли правящие и викарные архиереи, клирики, монашествующие и миряне. В соответствии с Уставом Собора 1917–1918 гг. викарные архиереи по статусу не являлись его членами. Процедура избрания на Собор представителей от клира и мирян и их квота устанавливались, согласно Уставу 1988 г., Священным Синодом. Поместному Собору предоставлялась высшая власть в церкви, и в частности, право истолковывать учение церкви, сохраняя вероучительное и каноническое единство с другими православными церквами, решать канонические, богослужебные, пастырские вопросы, утверждать, изменять, отменять и разъяснять свои постановления, канонизировать святых, избирать патриарха, утверждать постановления архиерейского Собора, – тем самым архиерейский Собор ставился в подчинённое положение по отношению к поместному Собору.