Устав 1988 г. предусматривал существование следующих синодальных учреждений: Управления делами Московской патриархии с канцеляриями патриарха и Синода, синодальной библиотекой и архивом, Отдела внешних церковных сношений, Издательского отдела, Хозяйственного управления, Учебного комитета, Пенсионного комитета. Высшее управление РПЦ по действующему Уставу, принятому архиерейским Собором 2000 г. «Устав Русской Православной Церкви» провозглашает органом высшей церковной власти поместный Собор в составе епископов, клириков и мирян, а органом высшего церковного управления – архиерейский Собор. Устав признаёт за поместным Собором высшую власть в области вероучения и канонического устроения РПЦ. В отличие от положения Устава 1988 г. сроки созыва поместного Собора не регламентируются самим Уставом – принимать соответствующее решение предоставляется архиерейскому Собору. В исключительных случаях поместный Собор может быть созван патриархом Московским и всея Руси или Местоблюстителем и Священным Синодом. Поместный Собор состоит из архиереев, представителей клира, монашествующих и мирян, избираемых в количестве и порядке, определяемых архиерейским Собором. Ответственность за подготовку поместного Собора устав возлагает на архиерейский Собор. В случае если поместный Собор созывается патриархом или Местоблюстителем и Священным Синодом, предложения о программе, повестке дня, регламенте заседаний и структуре поместного Собора утверждаются архиерейским Собором. Членами Собора являются епархиальные и викарные архиереи Русской церкви по своему положению. Процедура избрания на Собор представителей от клира, монашествующих и мирян и их квота устанавливаются архиерейским Собором, а в исключительных случаях Священным Синодом с последующим утверждением архиерейским Собором. Полномочия власти поместного Собора, в основном, повторяют полномочия, изложенные в Уставе 1988 г. Председателем Собора является Патриарх Московский и всея Руси, а в отсутствие патриарха – Местоблюститель Патриаршего престола. Кворум Собора составляют две трети его членов, включая две трети архиереев от общего числа иерархов – членов Собора. Поместный Собор избирает соборный президиум, секретариат и формирует рабочие органы. Президиум Собора состоит из председателя (патриарха или Местоблюстителя) и 12 членов в архиерейском сане (в Уставе 1988 г. – восемь). Президиум руководит заседаниями Собора. Секретариат Собора состоит из секретаря в архиерейском сане и двух помощников – клирика и мирянина. Секретариат несёт ответственность за обеспечение членов Собора рабочими материалами и за ведение протоколов заседаний. Президиум, секретарь и председатели рабочих органов составляют Соборный совет, который является руководящим органом Собора.