К 1744 г. Московский во имя Иоанна Златоуста монастырь владел 556 крестьянами; в 1764 г. причислен к необщежительным обителям третьего класса, недвижимое имущество было отнято, братии положено денежное жалованье (806 руб. 30 коп.). В 1775 г. монастырю возвращена (подтверждена) архимандрития. При императоре Павле I было увеличено штатное жалованье братии с 806 руб. 30 коп. до 1460 руб.; в собственность Московского во имя Иоанна Златоуста монастыря перешла мельница в Дмитровском уезде и огородная земля за Симоновым монастырём, Румянцевская пустошь в Подольском уезде, луговая земля с прудом в сельце Владычине Московского уезда. В 1800 г. митрополит Московский и Коломенский Платон (Левшин) составил монастырские правила: «Получаемые с земель деньги все обращать на содержание» Московского во имя Иоанна Златоуста монастыря; «где с земель приход есть натурою – хлебом, употреблять его на содержание настоятеля и братии»; «с лугов сено и получаемые за сено деньги все употреблять на конюшню, на корм лошадям, на покупку овса»; половину доходов, «получаемых с мельниц прочих монастырей», также рекомендовалось оставлять в Московском во имя Иоанна Златоуста монастыре; доход от рыбных ловель («натурою или деньгами») разделять среди настоятеля и братии. В 1801 г. монастырская земля (60,5 сажени) у Покровских ворот была передана купцам П. и С. Аверкиевым для строительства гостиницы; часовня раньше была упразднена. Среди благотворителей Московского во имя Иоанна Златоуста монастыря исследователи выделяют Апраксиных. Несколько поколений представителей этой династии благоустраивали монастырь, построили три церкви: во имя великомученика Феодора Стратилата, мученика Василиска и в честь Благовещения Пресвяятой Богородицы. В монастырь передали два паникадила шведской работы – трофеи Северной войны. Медное паникадило (7 пудов 2 фунта) было передано в Троицкую церковь в 1729 г. наследниками генерал-адмирала Фёдора Матвеевича Апраксина на его поминовение. В верхней части оно имело 24 шандала для свечей, а в нижней на медном яблоке – надпись на шведском языке с именами жертвователей и датой – 1696 г. Согласно надписи, паникадило было подарено церкви шведским городом Ваза (ныне Вааса, Финляндия). В русских военных хрониках зафиксировано, что «9 сентября 1714 года галерный флот под командованием генерал-адмирала Апраксина прибыл из Аландских шхер к городу Ваза для действий отсюда против шведского побережья». Другое паникадило, медное, высеребренное, на десять шандалов, украшало церковь святых Захарии и Елисаветы. Надпись на шведском и латинском языках имела дату – 1703 г.: «Да просветит Бог сердца верующих светом большим, сравнительно с тем, какой будет разливать в храме сей канделябр». На рубеже 1920 и 1930 гг., после закрытия Московского во имя Иоанна Златоуста монастыря, оба паникадила были взяты на учёт музейного подотдела Московского отделения народного образования как исторические ценности. Исследователям известно, что в январе 1929 г. финляндский посланник вёл переписку о возврате их в город Вааса и выражал готовность возместить их стоимость «по справедливой оценке». Паникадила были оценены в 2,4 тыс. руб. и при внесении этой суммы могли быть проданы в Финляндию. Благодаря сохранившимся фотографиям их удалось идентифицировать в собрании Музея Похьянмаа и природного центра Терранова (город Вааса).