В нескольких опубликованных в журнале статьях развивал концепцию «духовной власти», т.е. основывающейся на моральном и интеллектуальном авторитете власти философов и учёных (рассуждения Огюста Конта здесь во многом предвосхищают его позднейшее учение о позитивистском «священстве»). К середине 1820 гг. у О. Конта сложилось твёрдое убеждение, что его миссия как философа состоит в разработке построенного по строгим правилам науки учения об обществе и об общественном прогрессе. Полагая, что путём обоснования строго научного характера этого учения и демонстрации его взаимосвязи с другими науками он сможет добиться принятия позитивной философии французскими и европейскими интеллектуальными кругами и приобрести репутацию «научного философа», Огюст Конт принял решение обратиться к философскому осмыслению содержания естественных наук. Весной 1826 г. он начал читать в своей квартире цикл лекций под общим названием «Курс позитивной философии». Интерес к лекциям проявили многие учёные; среди слушателей были учёный-энциклопедист Александр фон Гумбольдт (1769–1859 гг.), медик Франсуа Бруссе (1772–1838 гг.), биолог Анри-Мари Дюкроте-де-Бленвиль (1777–1850 гг.), математик и физик Жан-Батист Жозеф Фурье (1768–1830 гг.) и др. После двух вводных лекций и первой лекции по математике курс был прерван по причине внезапного психического заболевания Огюста Конта. В состоянии острого маниакально-параноидального психоза, причинами которого сам Огюст Конт впоследствии считал конфликтные отношения с супругой и умственное переутомление, Огюст Конт предпринял попытку суицида, после которой был помещён друзьями в клинику известного парижского психиатра Жана-Этьена Доминика Эскироля (1772–1840 гг.), где находился около восьми месяцев. В декабре 1826 г. психическое расстройство Огюста Конта было признано неизлечимым; он был выписан из клиники и находился дома под надзором супруги. В домашней обстановке здоровье Огюста Конта неожиданно начало улучшаться; в конце 1826 – начале 1827 гг. его интеллектуальные способности восстановились, и он страдал лишь от одиночных приступов параноидальной агрессии, сменявшихся депрессивными и суицидальными настроениями. Осенью 1827 г. Огюст Конт вновь начал давать частные уроки математики, однако избегал философских занятий, опасаясь, что они вновь приведут к психическому расстройству. Лишь в конце 1828 г. он решился возобновить философскую деятельность, начав публиковать журнальные статьи. В январе 1829 г. Огюст Конт возобновил чтение лекций по позитивной философии; в декабре того же года завершил курс, прочитав всего 72 лекции. В начале 1830 г. ему удалось договориться с издателями о публикации переработанного и расширенного текста лекций под заглавием «Курс позитивной философии» («Cours de philosophie positive»). Работа над этим масштабным проектом была основным занятием Огюста Конта в 1830 гг.; объём сочинения постоянно увеличивался, а сроки завершения отдалялись. В 1830 г. был издан первый том, содержавший вводные лекции и лекции по математике; второй том, включавший лекции по астрономии и физике, вышел в 1835 г.; третий том, в который были помещены лекции по химии и биологии, – в 1838 г.