Возмущённый этими требованиями, Сен-Симон опубликовал два издания трактата: на титульном листе первого издания, напечатанного в количестве 100 экз. (которые были переданы Огюсту Конту), было помещено название «Система позитивной политики. Том первый, часть первая», а также указан автор: «Огюст Конт, ученик Политехнической школы, ученик Анри Сен-Симона»; второе издание, опубликованное тиражом 1000 экз., содержало дополнительный титульный лист с заглавием «Катехизис промышленников. Тетрадь третья», а также краткое предисловие Сен-Симона, в котором он признавал авторство Огюста Конта, однако сообщал о своих разногласиях с ним, а также о том, что при написании трактата Огюст Конт уклонился от поставленной перед ним задачи, предложив вместо систематизации взглядов Сен-Симона собственные рассуждения по занимавшим его философским вопросам. Таким образом, основной причиной разрыва между Огюстом Контом и Анри Сен-Симоном было желание Огюста Конта освободиться от внешнего влияния Сен-Симона и заявить о себе как о самостоятельном мыслителе. Однако к этому времени между ними уже существовали и серьёзные идейные разногласия: Сен-Симон упрекал Огюста Конта в сциентизме и «аристотелизме», отмечая, что он ставит научную способность человеческого разума выше философской, промышленной и духовной, т.е. морально-религиозных способностей; Огюст Конт со своей стороны отмечал, что Сен-Симон не пожелал освободиться от религиозной морали и индивидуалистического сентиментализма, вследствие чего подчинил философию религиозному чувству индивида и тем самым фактически лишил её научного статуса. В начале 1820 гг. Огюст Конт познакомился с Каролиной Массен; 19 февраля 1825 г. они вступили в светский брак. По свидетельству многих современников и друзей Огюста Конта, К. Массен проявляла интерес к его философским идеям и относилась к нему с уважением и заботой, однако вследствие различного интеллектуального уровня супругов, а также несходства их характеров и привычек совместная жизнь оказалась неудачной. Согласно утверждениям Огюста Конта, содержащимся в составленном им за год до смерти секретном приложении к завещанию, К. Массен до знакомства с Огюстом Контом зарабатывала на жизнь проституцией; совместная жизнь с ней была для Огюста Конта источником постоянного нервного напряжения и моральной неудовлетворённости. Современные исследователи скептически оценивают уничижительные высказывания Огюста Конта о К. Массен, полагая, что они, по меньшей мере, являются сильным преувеличением, а возможно, и вовсе недостоверны. С течением времени отношение Огюста Конта к Каролине Массен становилось всё более презрительным и враждебным; с 1842 г. супруги жили раздельно и не встречались, однако состояли в переписке.