В 1254 г. французский король Людовик IX Святой разрешил нескольким французским кармелитам основать обитель в Шарантоне близ Парижа. В то же время численность кармелитов, оставшихся в Палестине, продолжала увеличиваться. Кармелиты открыли подворье монастыря в Акре, около 1254 г. был основан монастырь в Тире. В 1263 г. ввиду увеличения братии монастырь на горе Кармил значительно расширили и перестроили; средства на сооружение новых зданий были собраны в том числе благодаря поддержке папы Римского Урбана IV, предоставившего 100-дневную индульгенцию тем, кто жертвовали на монастырь. В середине 1260 гг., когда войска султана Бейбарса I вытеснили крестоносцев из Палестины, кармелитам пришлось оставить Кармил и укрыться в крепости Акра. Они смогли вернуться в монастырь лишь по условиям перемирия 1283 г. Исследователи полагают, что кармелиты покинули Палестину до падения последнего оплота крестоносцев – Акры (май 1291 г.), но, согласно орденскому преданию, последние кармелиты на горе Кармил приняли мученическую кончину от сарацин. В Европе переселявшиеся из Палестины кармелиты первоначально воспринимались неоднозначно – несмотря на то что устав Ордена был одобрен Папским престолом, местные епископы часто препятствовали основанию монастырей кармелитов под предлогом решений четвёртого Латеранского собора (1215 г.), запретившего создание новых монашеских Орденов. Критике подвергались особенности литургического обряда кармелитов, их полосатые плащи, были сложности с соблюдением пустынножительного устава, лишавшего монахов возможности добывать средства к существованию. В 1247 г. на первом генеральном капитуле Ордена, который собрался в монастыре в Эйлсфорде, был избран генеральный приор кармелитов (им стал католический святой Симон Сток, ум. в 1265 г.) и приняты поправки к уставу, которые сближали кармелитов с нищенствующими Орденами (доминиканцами и францисканцами). По предложению Симона Стока капитул разрешил строить монастыри в городах, поправками к уставу вводились общая трапеза братии, совместное ежедневное чтение бревиария монахами, имевшими сан пресвитера, время безмолвия ограничивалось ночными часами (от повечерия до первого часа), за монастырями закреплялось право владеть собственностью, монахам разрешалось употребление мяса вне обители. Новый устав был утверждён буллой папы Римского Иннокентия IV «Que honorem conditoris» от 1 октября 1247 г. Изменение устава позволило Ордену заниматься проповеднической и благотворительной деятельностью в городах, открывать монастыри при университетах. При Симоне Стоке кармелитские обители были основаны в Ньюэме (1249 г., в 1290 г. перенесена в Кембридж), Оксфорде (1256 г.), Париже (1259 г.) и Болонье (1260 г.), в провинциях создавали орденские школы (studium generale), где получали образование будущие пресвитеры- кармелиты (к 1434 г. была открыта 21 школа). Несмотря на послабления, допущенные в новом уставе кармелитов, он отличался большей строгостью по сравнению с уставами доминиканцев и францисканцев, что влияло на общую численность кармелитов и замедляло рост Ордена. В то же время часть кармелитов считали, что новый устав противоречил изначальной аскетической и отшельнической направленности Ордена.