Третий цикл, страстей и смерти Иоанна Предтечи, содержит сцены «Обличение Ирода и Иродиады», «Святой Иоанн Предтеча в темнице», «Танец Саломеи», «Усекновение главы святого Иоанна Предтечи», «Пир Ирода» или «Вручение главы святого Иоанна», «Погребение святого Иоанна Предтечи учениками». Иконография «Усекновения главы святого Иоанна Предтечи» восходит к ранневизантийской эпохе: обычно святой изображается со связанными за спиной руками, лежащим на земле, палач держит его за волосы и заносит меч («Усекновение главы святого Иоанна Предтечи», Караваджо, 1608 г., кафедральный собор Сан-Джованни в Валлетте, Мальта). В сцене «Пир Ирода» отсечённую голову держит на блюде юная Саломия (мозаика баптистерия собора Сан-Марко в Венеции, 1343–1354 гг.), но иногда слуга или воин. Сцена «Погребение святого Иоанна Предтечи» представлена на фоне пейзажа и нередко служит дополнительным мотивом на дальнем плане в композиции «Вручение главы святого Иоанна Предтечи». Исследователи редко встречают сцены «Иродиада наущает Саломию попросить в награду за танец голову Крестителя» (так называемый Реликварий Барбароссы, 1178 г., Музей собора Сан-Лоренцо, Генуя); «Святой Иоанн, заключённый в темнице, посылает двух учеников ко Христу» (Андреа Пизано, бронзовый рельеф южных врат баптистерия Сан-Джованни, Флоренция, около 1330 г.); «Сошествие святого Иоанна во ад» (шитый фрагмент покрова на алтарь баптистерия Сан-Джованни, 1466–1488 гг., по рисунку Антонио дель Поллайоло, Музей собора Санта-Мария дель Фьоре во Флоренции). Одним из сюжетов западной иконографии исследователи называют картину «Святой Иоанн обезглавленный», где Иоанн Предтеча показан с отсечённой головой на серебряном блюде. С начала XIV в. появились изображения отсечённой головы святого, лежащей на блюде: медный рельеф (XVI в., Музей Майер ван ден Берг, Антверпен); «Глава святого Иоанна Крестителя» (около 1330 г.; Баварский национальный музей, Мюнхен). Этот образ получил широкое распространение как эмблема Братства милосердия и других религиозных Орденов, окормлявших приговорённых к казни через отсечение головы. По мнению исследователей, его прототипом послужил византийский реликварий святой главы Иоанна Предтечи, вывезенный крестоносцами в Европу в 1204 г. Четвёртый цикл, связанный с реликвиями Иоанна Предтечи, представляет историю со времени императора Юлиана Отступника, приказавшего откопать из земли и сжечь мощи святого. На портале собора святого Иоанна Предтечи в Сансе (XIII в.) помещены сцены «Юлиан Отступник приказывает отрыть и сжечь останки Крестителя», «Император Валент приказывает привезти главу Иоанна Крестителя во дворец, но кони отказываются двинуться с места», «Иоанн Креститель открывает монаху Маркеллу место, где хранятся под спудом его мощи», «Император Феодосий приказывает доставить мощи в Константинополь, где для них возводится базилика».