В 1837–1841 гг. Смоленская церковь была перестроена в провинциальных позднеампирных формах. К ней были присоединены низкая каменно-деревянная надстройка с пологим куполом и четырёхколонные портики с севера и юга. В 1802 г. монастырь был обнесён каменной оградой. Над главными западными воротами на пожертвования иркутского коллежского советника Петра Петровича Гирязина была возведена церковь в честь Сретения Господня (1816–1823 гг.). Её объёмное построение повторяло редкую композицию Вознесенского собора: два монументальных убывающих восьмерика были увенчаны небольшим восьмериком со шпилем; в плане с востока примыкала апсида. В 1840 гг. храм был перестроен, позже разобран. На его месте на средства иркутского купца Ивана Ивановича Базанова выстроили каменную трёхъярусную колокольню (1878–1881 гг.), архитектура которой сочетала элементы русско-византийского стиля и барокко: высокий столп колокольни с двумя ярусами звона, оформленными колоннами и пилястрами, завершался стилизованным двухъярусным шатром. На колокольне находилось 13 колоколов, самый большой (1357 пудов 35 фунтов) был отлит в Иркутске в 1875 г. Среди колоколов особым «малиновым» звоном отличался «серебряный», как его называли, колокол, отлитый в Москве 25 апреля 1764 г. В начале XIX в. настоятель Иркутского монастыря и ректор семинарии архимандрит Иакинф (Бичурин) установил на колокольне башенные часы. В начале XIX в., во время строительства ограды Иркутского монастыря, были обнаружены деревянный гроб-колода с останками старца Герасима и каменная плита с надписью: «1676 года Генваря 20 дня представился сего Вознесенскаго монастыря первый строитель схимонах Герасим». В 1802 г. на средства купца Николая Семёновича Чупалова над могилой схимонаха Герасима была сооружена каменная двухэтажная часовня, представлявшая собой двухъярусный восьмерик, на нижнем этаже которого помещалось надгробие подвижника, а на верхнем находились библиотека (в конце XIX в. более 3 тыс. книг) и архив. С 1910 г. в соборе Иркутского монастыря каждую субботу по старцу Герасиму совершалась панихида, а в часовне на его могиле – лития. Другая часовня (1836 г.), над св. источником (рядом с Успенской церковью), выполнена в виде невысокой ротонды с пологим куполом, декорированной в скромных формах позднего ампира. Над могилой архимандрита Синесия (ум. в 1787 г.) была поставлена восьмигранная часовня (1864–1865 гг.) с большим луковичным куполом; её скромный декор состоял из классицистических и русско-византийских элементов. В 1898 г. справа от св. ворот на месте старого одноэтажного был построен двухэтажный каменный настоятельский корпус, на втором этаже которого располагались покои настоятеля – епископа Киренского, на первом – кельи братии. В северном углу монастырской территории близко друг к другу были выстроены другой братский корпус, школа, библиотека, баня и хозяйственные здания. От св. ворот к собору была проложена широкая аллея, вымощенная каменными плитами. Такие же аллеи соединяли настоятельский и братский корпуса со школой и собор с Успенской церковью. Напротив настоятельского корпуса был устроен фонтан в виде креста.