В трёх верстах к западу от Иркутского монастыря на монастырских землях 3 марта 1872 г. была заложена, а 27 июня 1876 г. освящена небольшая деревянная церковь во имя архангела Михаила с колокольней (сохранилась) и часовней, положившая начало скиту. В 1898 г. близ храма была проложена железная дорога и на отчуждённых от монастыря землях основана станция Иннокентьевская (ныне станция Иркутск-Сортировочный), скит превратился в крупную монастырскую ферму, на территории которой находились скотный двор, маслобойня и кирпичный завод, приносившие значительный доход. Иркутский монастырь посещали много паломников не только из Иркутской губернии, но и из Центральной России. За оградой Иркутского монастыря напротив колокольни в 1900–1903 гг. была построена каменная двухэтажная гостиница. Обычно в год Иркутский монастырь посещали до 5 тыс. человек, в 1910 г. – 6042, а в 1913 г. – 8544 человека. Паломники пользовались бесплатным трёхдневным проживанием в гостинице, хлебом, угощением от братской трапезы, чаем. Бедные паломники иногда получали денежное пособие. В епархиальном отчёте за 1880 г. отмечено, что богослужение в монастыре «продолжительное, совершается строго по уставу. Для пения имеется хор из братии и учеников училища, дирижируемый опытным регентом. Каждое воскресенье совершается соборне молебен св. Иннокентию, а по вторникам также правит ему акафист». Тихвинская церковь (длиной 10 сажён и 1 аршин и шириной 9,5 сажён) – одно из немногих деревянных зданий, сохранявшихся в Иркутском крае с 1692 г. до 1930 гг. Одноглавый основной объём храма завершался характерной для местного барокко кровлей (возведённой, как полагают исследователи, после пожара 1783 г.), с запада к нему примыкала трапезная. В церкви находился неполный старинный четырёхставный иконостас; на трёх верхних ярусах были иконы, написанные одновременно с постройкой храма, нижний, местный чин был поновлён и украшен золочёной резьбой. В 1835–1839 гг. был проведён ремонт: храм обшили досками, кровли покрыли железом, в нижнем ярусе, под склепом, в котором покоились мощи святителя Иннокентия, устроили придел Иннокентия Иркутского. В церкви хранилось два деревянных гроба, в 1731–1805 и 1805–1808 гг. в них почивали останки святителя. Первый из них был помещён в стеклянный с бронзовыми рамами футляр, над которым устроен балдахин. На западной стене храма в особом застеклённом шкафу хранились личные вещи Иннокентия (парчовая епитрахиль, риза, панагия, камилавка, кожаные сандалии и др.), а «в особо устроенном помещении» – «старинная карета, в каковой при жизни ездил в торжественных случаях по городу Иркутску св. Иннокентий». К 1864 г. в Тихвинской церкви, ризницах Иркутского монастыря и кафедрального Богоявленского собора были представлены 37 предметов, принадлежавших святителю. Сохранившиеся архиерейская мантия и парчовая фелонь Иннокентия после 1917 г. находились в собрании Иркутского областного краеведческого музея, в 1990 г. были переданы Иркутской епархии. По преданию, фелонь, расшитую речным жемчугом и украшенную вызолоченными бляшками, подарил Иннокентию император Пётр I, присутствовавший при его хиротонии в Александро-Невской лавре.