Приделы, представлявшие собой самостоятельные объёмы в скромных формах позднего барокко, завершались восьмериками, имели неглубокие западные компартименты и апсиды. По мнению исследователей, около 1811 – 1813 гг. был построен и притвор-лоджия, примкнувший к колокольне с запада и открывавшийся вовне четырёхколонным аттиком. Притвор был перекрыт высокой двускатной кровлей сложных барочных очертаний. В 1863 г. обветшавший Вознесенский храм был разобран до основания (при этом мощи Иннокентия временно были поставлены в монастырской Успенской церкви), и на том же месте 20 мая того же года заложен, а 15 октября 1872 г. освящён одноимённый каменный собор (архитектор Владислав Андреевич Кудельский). Устроенные в том же году престолы в боковых апсидах были посвящены святителям Иннокентию Иркутскому (правый) и Митрофану и Тихону Воронежским (левый), в подклете – преподобным Антонию и Феодосию Киево-Печерским. Храм, возведённый в русско-византийском стиле (в стиле построек Константина Андреевича Тона), имел пять массивных луковичных глав на широких барабанах, был четырёхстолпным, квадратным в плане, с выступающими объёмами неглубокого притвора и полуциркульной апсиды, а также с тремя крыльцами – с запада, севера и юга. В мае 1780 г. в Иркутском монастыре была заложена, а 19 октября 1783 г. архимандритом Синесием (Ивановым) освящена церковь в честь Успения Пресвятой Богородицы. Второй престол храма, во имя Евфимия Суздальского, был освящён в 1786 г., но впоследствии упразднён. Успенская церковь была построена на месте одноимённой деревянной (освящена епископом Иннокентием (Неруновичем) в 1741 г.; имела статус соборной на время строительства каменного собора). Сохранившийся храм построен в скромных формах позднего барокко. Невысокий четверик был перекрыт широким восьмилотковым куполом с главкой. Среди редких особенностей церкви исследователи отмечают наличие двух апсид, близких по размеру и увенчанных одинаковыми главками на небольших восьмериках. В 1802 г. храм стал угловой частью новой, каменной ограды. 20 октября 1810 г., после ремонта, состоялось освящение всего храма, а 31 января 1811 г. – придела во имя Сергия Радонежского. В 1874–1875 гг. с запада к Успенской церкви было пристроено здание трапезной с кухней, в 1910 г. расширенная постройка была включена в южное прясло новых монастырских стен. В храме находилась почитаемая икона-пелена Иннокентия Иркутского, вышитая «серебром по чёрному бархату» иркутянкой Е.А. Постниковой (около 1775 – 1854 гг.) в дар императору Николаю I. Царь с благодарностью принял этот образ, но вскоре передал его в Иркутск. К началу XX в. богослужения в Успенской церкви совершались только в дни престольных праздников. В северной части Иркутского монастыря на средства игумена Гавриила (Копырина) была построена каменная церковь в честь Смоленской иконы Божьей Матери (1795–1809 гг.). Этот храм, известный исследователям только по схематическому рисунку Ивана Ефимовича Кожевина 1816 г., был увенчан семью главами, стены были с «петрыми украшениями», небольшие окна имели различную форму. Судя по рисунку, небольшой храм с деревянными завершениями имел сложную композицию, близкую к украинской архитектурной традиции.