За три недели до смерти Мария Шварновна приняла решение постричься в монахини, что было исполнено 2 марта 1206 г. В Княгинин монастырь её провожали муж, сын святой благоверный великий князь Георгий (Юрий) Всеволодович, любимая дочь княгиня Всеслава, «иже бе приехала ко отцю и матери своеи, и не мочи видети туги», епископ Иоанн и другие представители духовенства, боярство и горожане. В летописный рассказ об этом событии был включён панегирик, посвящённый Марии Шварновне: «...И нищелюбица, и страннолюбица, печальныа и ноужныя, и болныя, тех всех оутешаше, и подаваше им требование» («Полное собрание русских летописей», том 1, выпуск 2). Перед смертью княгиня приняла схиму с именем Марфа. Мария Шварновна была торжественно похоронена в правой стене у алтаря Благовещенского придела четырёхстолпного одноглавого Успенского собора Княгинина монастыря, построенного на средства её семьи в 1198/1199 – 1202 гг. На её похоронах присутствовали муж, все сыновья (за исключением великого князя Константина Всеволодовича, находившегося в Новгороде), многие жители Владимира-на-Клязьме, духовенство – Смоленский епископ Игнатий и настоятель тверского Отроча в честь Успения Пресвятой Богородицы монастыря игумен Михаил, гости и послы («Полное собрание русских летописей», том 1, выпуск 2). В связи с последними днями жизни Марии Шварновны упоминается её духовный отец – настоятель владимирского в честь Рождества Пресвятой Богородицы мужского монастыря Симон, постриженик Киево-Печерского монастыря (см. Киево-Печерская лавра), будущий епископ Владимирский и Суздальский (1214/1215 – 1226 гг.) и один из авторов «Киево-Печерского патерика». На протяжении многих лет он был духовником не только Марии Шварновны, но и некоторых её детей («Полное собрание русских летописей», том 1, выпуск 2). В Летописную «Повесть об убиении святого благоверного великого князя Андрея Юрьевича Боголюбского» в виде молитвы была включена похвала семье великого князя Всеволода Георгиевича, отомстившего убийцам своего старшего брата: «Богу молися помиловати князя нашего и господина Всеволода, своего же приснаго брата да подасть ему победу на противныя, и многа лета съ княгынею и съ благородными детми и мирну державу ему и царство его ныня и присно в бесконечныя векы аминь» («Полное собрание русских летописей», том 1, выпуск 2). Объёмный текст, прославляющий мудрую и боголюбивую Марию Шварновну, сохранился в составе Симеоновской летописи конца XV в. (в связи с напутствием ею и мужем в 1205 г. их старшего сына Константина Всеволодовича, ставшего Новгородским князем). В этом рассказе Мария Шварновна уподоблялась византийской императрице святой Елене, блаженной Феодоре и Киевской святой равноапостольной великой княгине Ольге (Елене). Мария Шварновна была старшей сестрой княгини Анны (Елены?), жены Новгородского князя Ярослава Владимировича, а также княгини Марфы Ясыни, жены Черниговского и Козельского князя Мстислава (Пантелеимона) Святославича («Полное собрание русских летописей», том 2).