Хотя структура Литовской митрополии первой трети XIV в. по источникам того времени исследователям неизвестна, но, судя по данным середины XIV в., митрополичья кафедра находилась в Новогородке (ныне Новогрудок, Белоруссия), имея в подчинении, как минимум, Полоцкую кафедру. Исследователи полагают, что кафедра получила от Литовского великого князя десятину и земельные владения, которые перешли после упразднения Литовской митрополии Киевскому митрополиту. Итак, положение дел было таково, что политически мотивированные требования об отдельной митрополии для западнорусских земель должны были возбуждаться едва ли не всякий раз при замещении Киевской кафедры. Действительно, практически одновременно с поставлением на митрополию Алексия в 1354 г. в Константинополе удовлетворили настоятельное желание великого князя Литовского Ольгерда (1345–1377 гг.), возобновив в 1355 г. Литовскую митрополию во главе с митрополитом Романом, чья кафедра разместилась в Новогородке (в летописи сообщается, что Роман пробовал обосноваться в Киеве «и не прияша его кияне» («Полное собрание русских летописей», том 17); несмотря на это, Литовский митрополит приезжал в Киев, совершал здесь богослужения и хиротонии). Роман и его покровители (митрополит был свояком великого князя) претендовали на Киевскую митрополичью область, которой фактически Роман и овладел, Брянско-Черниговскую и даже Тверскую епархии, надеясь стать во главе общерусской митрополии с центром в Великом княжестве Литовском. Ради умиротворения его в Константинополе приговорили, чтобы к двум литовским епископиям Романа (Полоцкой и Туровской) присоединить все галицко-волынские кафедры. Это разделение упразднилось со смертью Романа в 1361/1362 г. решением патриарха Каллиста I, которое было подтверждено и патриархом Филофеем Коккином немедленно после вторичного его вступления на престол в 1364 г. (Исследователи полагают, что попыткой возобновить Литовскую митрополию была хиротония на Киевскую кафедру в 1352 г. Болгарским патриархом в Тырнове инока Феодорита; поставление Феодорита было осуждено в Константинополе, но ему удалось в продолжение, по крайней мере, двух лет управлять церковными делами в Киеве.) При этом патриарх Филофей снова открыл Галицкую митрополию из внимания к угрозам польского короля Казимира III Великого (1333–1370 гг.) в случае отказа от создания кафедры принудить подвластных ему православных к переходу в католичество. Этот акт ставит перед исследователями ряд вопросов. В пределы возобновлённой Галицкой митрополии входили, согласно грамоте патриаршего Собора (май 1371 г.), Холмская, Туровская, Перемышльская и Владимирская (на Волыни) епархии, а согласно патриаршему посланию к митрополиту Алексию – только Владимирская, Перемышльская и Холмская, «которые находятся под властью ляшского короля: больше мы ему ничего не дали, ни Луцка, ни другой какой [епископии]». Очевидно, границы учитывали территориальные приобретения Казимира III по литовско-польскому договору 1366 г. (Холм, Владимир) и присоединение к ним ещё и Турова остаётся для исследователей непонятным.