Сведения о жилых и хозяйственных постройках Космина Яхренского монастыря сохранились с XVII в. В писцовой книге 1644–1648 гг. указываются деревянные келья игумена и семь братских келий, по описи 1665 г. – деревянные игуменская келья и пять братских. Подробно жилые здания монастыря перечисляются в «офицерской» описи 1763 г.: две покрытые тёсом деревянные кельи настоятеля «об одном апартаменте» с сенями и чуланом, наверху которых находилась небольшая крытая тёсом келья; восемь братских каменных келий «о двух апартаментах», между ними «вверху» находилась девятая, деревянная келья (Российский государственный архив древних актов). В 1766 г. при кельях настоятеля выстроена особая пятистенная келья «для печенья хлеба и приготовления кушаний», которую в 1784–1785 гг. перестроили. В 1801 г. были сооружены ещё несколько келий для братии. В 1803–1806 гг. уже обветшавшие кельи были перестроены, возведён второй этаж (Государственный архив Владимирской области). В 1863 г. обветшавший келейный корпус был полностью перестроен и покрыт железной крышей, в пустовавших помещениях устроены 17 келий (Отдел письменных источников Государственного исторического музея). К середине XVII в. конюшенный и скотный дворы располагались под монастырём; в 1665 г. на территории обители находились «хлебня», два погреба, объединённые с сушилом, семь житниц, гумно с тремя овинами, за монастырём – «конюшня с 30 лошадями», двор воловенный с десятью коровами, пятью быками, пятью тёлками и 31 овцой; в 1671 г. дополнительно упоминаются «хлебодарня» и квасная. Более подробно учтены постройки в описи 1763 г.: шесть деревянных «магазейнов», каменная «хлебня», поварня, две кладовые «палаты», два погреба, сарай «для ставки» колясок, телег, саней; за монастырской оградой стояли «поваренный сарай» для приготовления пива, баня, конюшня, скотный двор, сараи для соломы и корма, три овина и гумно (Российский государственный архив древних актов).  По ведомости 1892 г., при въезде в восточные ворота находились помещения для странников и богомольцев, двухэтажный сарай для экипажей (в верхнем хранилось сено), каменная конюшня, баня. До середины XVIII в. ограда Космина Яхренского монастыря была деревянной. В описи 1665 г. значатся «ворота Святые с прикалитком, деревянные, ветхи, в Деисусе на воротах 5 образов, писаны на оба лица, ветхи». В описи 1671 г. указаны уже дубовые святые ворота, рублёная четырёхугольная ограда, покрытая тёсом, выстроенная при игумене Митрофане. Строительство новой ограды, по мнению исследователей, не было закончено. Незавершённую часть составляло «прясло в столбах до старых Святых ворот». Все эти сооружения находились в ветхом состоянии, и для их ремонта была заготовлена 1 тыс. брёвен. В 1763 г. входные ворота в монастырь были каменными, направо от них сохранилась деревянная, покрытая тёсом ограда с четырьмя небольшими деревянными башнями по углам. «Всего вокруг оной ограды 194 сажени» (Российский государственный архив древних актов). В декабре 1775 г. под Никольским храмом были устроены новые, каменные святые ворота. В 1797 г., по мнению исследователей, частично продолжилось возведение каменной ограды, но большая её часть оставалась деревянной.