В 1776 г. открылись семинарии при боровском Пафнутиевом монастыре и при Лаврентиевом калужском монастыре. В 1776–1777 гг. Синод обсуждал вопрос об упразднении Крутицкой епархии и о переносе кафедры в Калугу, но тогда это не было исполнено. В 1781 г. протоиерей крутицкого Успенского собора Димитрий Михайлов с соборянами просил Крутицкую консисторию о разрешении протопопу собора и другим соборянам освящать церкви в Крутицкой епархии, как это было прежде. Прошение было вызвано тем, что предоставление антиминсов для новооткрываемых церквей входило в компетенцию Синодальной конторы. Вскоре такое разрешение от Синодальной конторы было получено. 8 декабря 1786 г. последовал Высочайший указ о передаче архиерейской ризницы Крутицкой епархии архиепископу Екатеринославскому, что было выполнено в начале 1788 г. Указом императрицы Екатерины II от 6 мая 1788 г. предписывалось: «Крутицкой епархии не быть и до будущего соизволения нашего Калужскую губернию присоединить к епархии Московской». Тем же указом Крутицкий архиерейский дом передавался в ведение главнокомандующего. 26 мая 1788 г. Синодальная контора постановила все решённые дела Крутицкой консистории хранить в своём архиве. На момент упразднения в Крутицкой епархии насчитывалось 891 церковь, 15 монастырей и пустыней. В Коломенскую епархию перешли 126 храмов в Белёвском, Одоевском, Чернском, Крапивенском и Алексинском уездах. В Орловскую епархию перешли 68 церквей Болховского и Дешкинского уездов. К Смоленской епархии присоединились 22 церкви в Юхновском, Ельнинском и Гжатском уездах. Остальные 765 церквей перешли в Московскую епархию. Наиболее ранняя часть архива Крутицкой кафедры (дела Сарской епархии и Крутицкого подворья) отложилась в фонде «Коллекция столбцов Синодального собрания» в Историческом музее, среди них есть дела 1670–1680 гг., касающиеся, в частности, выборов поповских старост. В фонде Крутицкого (Сарского и Подонского) архиерейского дома в Российском государственном архиве древних актов хранятся дела конца XVIII – начала XIX вв. В Центральном государственном историческом архиве Москвы есть фонд Крутицкой духовной консистории. 8 декабря 1917 г. поместный Собор Православной Российской церкви 1917–1918 гг. принял определение «О правах и обязанностях Святейшего Патриарха Московского и всея России», которое предусматривало реорганизацию управления Московской епархией: «Патриаршей областью (Москва, Московская епархия, ставропигиальные монастыри) управляет по указаниям патриарха патриарший наместник с титулом архиепископа Коломенского и Можайского». Таким образом, была восстановлена епископская кафедра в Коломне (см. Коломенское викариатство). Московский епархиальный съезд 18–22 декабря 1917 г. признал «наиболее целесообразным способом избрания помощника Святейшему Патриарху считать назначение такового... самим Святейшим Патриархом по его личному усмотрению и избранию» (Российский государственный исторический архив). На этом настаивал патриарх Тихон, высказавший такое пожелание 20 декабря 1917 г. в беседе с председателем епархиального съезда протоиереем Григорием Соколовым, и последний в тот же день поставил на голосование вопрос об отказе от избрания управляющего епархией на съезде. За данную резолюцию съезда, несмотря на острые дискуссии (решениями поместного Собора был установлен принцип избрания архиереев), проголосовало 199 из 244 его участников (Российский государственный исторический архив).