В 1700 г. в Сарской митрополии насчитывалось 525 церквей. В 1700–1701 гг., после смерти патриарха Адриана, митрополит Сарский и Подонский Трифиллий был местоблюстителем Патриаршего престола. Его преемник Иларион (Властелинский) в 1703–1711 гг. имел титул «митрополит Сарский, и Подонский, и Козельский». В 1709 г. территория епархии уменьшилась: Вязьма с частью уезда и Дудинские волости перешли в Смоленскую епархию. Тогда же в пользу государства были отняты крупнейшие «домовые вотчины» Сарского архиерейского дома в Звенигородском, в Суздальском, во Владимирском, в Тамбовском и ряде других уездов. Архиерейский дом обеднел, царский духовник священник Иаков Игнатьев писал, что митрополит Иларион «только погребениями кормился». Поставленный на Крутицкую кафедру в 1711 г. преемник митрополита Илариона Феодосий (Вадбольский) имел титул «епископ Сарский и Подонский». 25 января 1719 г. на Крутицкую кафедру был назначен архиепископ Игнатий (Смола) с возведением в сан митрополита (Игнатий ещё в 1716 г., будучи епископом Суздальским и Юрьевским, принимал участие в управлении Патриаршей областью). С 23 февраля 1721 г. митрополит Игнатий (Смола) находился под следствием, 8 сентября 1721 г. был отрешён от кафедры. 10 апреля 1722 г. Сарский архиепископ Леонид (Петровский) был назначен управляющим Московской синодальной областью (епархией), в 1723 г. стал первоприсутствующим в Московской дикастерии, образованной 16 февраля 1722 г. В 1723 г. в ведение архиепископа Леонида поступила Московская канцелярия синодального правления, которая уже 27 июля 1726 г. была упразднена с передачей большей части функций в Московскую дикастерию. 29 мая 1737 г. сгорели здание Крутицкого подворья, денежная казна и документы. В 1739 г. архиепископ Леонид организовал Крутицкую епархиальную семинарию при вяземском во имя св. Иоанна Предтечи монастыре (Вязьма с 1709 г. принадлежала Смоленской епархии, часть Вяземского уезда осталась в составе Сарской архиепископии) на 30 учеников, на содержание которых собирали по копейке с каждого прихода Крутицкой епархии. В 1744 г. семинария была перенесена в Крутицкий архиерейский дом в Москве, в 1751 г. – в московский Покровский монастырь (впоследствии имела неофициальное наименование Покровская, монастырь назывался училищным). Настоятели монастыря были, как правило, ректорами семинарии. После восстановления в 1747 г. Московской епархии императрица Елизавета Петровна 20 марта 1748 г. постановила перевести Крутицкого архиепископа Платона (Малиновского) на Московскую кафедру. 14 апреля 1748 г. был издан указ о назначении Платона (Малиновского) архиепископом Московским и Севским. Сарским и Подонским архиепископом стал Иларион (Григорович), в 1748–1752, 1754–1759 гг. он был присутствующим членом Московской синодальной конторы. Манифест о секуляризации монастырских земель от 26 февраля 1764 г. привёл к упразднению 16 монастырей в Крутицкой епархии (десять мужских и шесть женских). Были преобразованы в приходские церкви мужские монастыри: Мещовский Драгошанский Троицкий, Боровский Высоцкий Покровский, Успенский Гремячев, Рождества Пресвятой Богородицы в селе Анастасове, Мосальский Боровенский Успенский, перемышльский Резванский Николаевский, ливенский Сергиевский, мценский Петропавловский, Серпейская Городеченская и белёвская Жабынская пустыни.