Меньше внимания стало уделяться и обновленцам, которые теперь рассматривались всего лишь как одно из религиозных течений, имевшее всё же некоторые преимущества перед патриаршей церковью. Это проявилось, в частности, в вопросе о высших духовных школах в Ленинграде. Там с 1924 г. с разрешения местных властей наряду с обновленческим Богословским институтом действовали и патриаршие Богословские курсы Центрального района. 7 января 1925 г. Комиссия по проведению отделения церкви от государства постановила: «Открытые с разрешения Ленинградского губисполкома две богословские академии (тихоновскую и обновленческую) соединить в одну обновленческую академию, о чем поручить т. Тучкову снестись с Ленинградом». Однако патриаршие Богословские курсы не только не были закрыты, но, преобразованные в сентябре того же года в Высшие Богословские курсы, продолжали работать до 1928 г. (что говорило о явном падении авторитета комиссии среди органов власти). Обновленцам по-прежнему разрешалось проведение публичных лекций, хотя и реже, и с большими ограничениями – «...исключительно на темы, носящие характер борьбы внутрицерковных течений. Не допускать чтения лекций, носящих апологетический или мистический характер». Получили обновленцы и разрешение на издание молитвенника на русском языке, поскольку, как заявил в поддержку этого предложения Е.М. Ярославский, богослужения на русском языке теряют свою «обаятельность и мистику». Особый интерес сохранялся у Комиссии по проведению отделения церкви от государства в отношении заграничной деятельности обновленцев, поскольку она давала надежды на установление контроля Советского государства над зарубежной собственностью Русской церкви. 1 ноября 1924 г. комиссия постановила: «Поручить тов. Тучкову через обновленческий синод начать кампанию по образованию за границей обновленческих групп, которым бы наши полпреды могли передавать церковное имущество в связи с признанием СССР». 2 февраля 1926 г., рассмотрев вопрос о «заграничных церковных имуществах», Комиссия по проведению отделения церкви от государства постановила: «1. Признать допустимым по отношению к заграничному церковному имуществу, там, где это необходимо по тактическим соображениям, предъявлять претензии на имущества и выступать в судах от имени Синода Русской Церкви (обновленческого), обеспечивая это путём соответствующих гарантий со стороны Синода. 2. В соответствии с этим поручить НКВД при участии тов. Красикова провести юридическую проработку этого вопроса по каждой стране. 3. Считать необходимым для ведения дел по заграничному церковному имуществу отпуск специальных сумм, для истребования которой поручить НКИД (Народный комиссариат иностранных дел) составить смету по каждой стране. Смету представить на комиссии». Наибольшим успехом Комиссии по проведению отделения церкви от государства была передача по решению американского суда в распоряжение обновленческого «митрополита Северной Америки» Ивана Саввича Кедровского кафедрального Николаевского собора в Нью-Йорке. Однако попытка отсудить Александро-Невский собор в Париже потерпела неудачу, подобный исход имели и судебные тяжбы в отношении русских храмов в Берлине.