Духовная школа фактически стала базой для организации в 1919–1920 гг. семинарии в Кременце после её закрытия в 1919 г. в занятом большевиками губернском городе Житомире. После окончания войны Корец в 1921 г. вошёл в состав Польши, Кременецкий в честь Богоявления монастырь играл исключительную роль в новообразованной Волынско-Кременецкой епархии. Фактически в его зданиях были размещены все епархиальные и административные учреждения: духовная консистория (в том числе епархиальный миссионерский комитет), покои правящего архиерея (до 1934 г. в них останавливался правящий архиерей Волыни митрополит Варшавский Дионисий (Валединский)), семинария с интернатом (общежитием), Богоявленское братство, богадельня и школа псаломщиков. При консистории функционировали типография и издательский отдел, выпускавший епархиальный календарь и журналы. Одноэтажный главный корпус был предназначен для насельников и наместника. В большом двухэтажном келейном корпусе в начале 1930 г. находилась квартира ректора семинарии. На территории обители также располагались свечной завод, библиотека (около 150 томов), иконная и книжная лавки, сторожка для садовника и хозяйственное помещение. После убийства в феврале 1923 г. патриаршего экзарха в Польше митрополита Георгия (Ярошевского) 29 апреля в Богоявленском храме обители состоялась интронизация архиепископа Кременецкого и Волынского Дионисия (Валединского) на кафедру митрополита Варшавского и всея Польши. В Кременецком в честь Богоявления монастыре 6 апреля 1924 г. хиротонисали викарного епископа Кременецкого Симона (Ивановского; бывшего наместника обители). Он исполнял обязанности настоятеля обители до 1927 г., в 1932–1934 гг., как епископ Острожский имел резиденцию в Кременецком в честь Богоявления монастыре. В 1923 г. в Богоявленском соборе был рукоположён на самостоятельную Виленско-Лидскую епархию архимандрит Феодосий (Феодосиев). В послевоенные 1920 гг. братия отстроила на хуторе Березина новый дом и два хозяйственных помещения. К 1934 г. в ведении обители находилось 202 десятины 1984 кв. сажён земли в городе и окрестностях, в том числе в Кременце – 9 десятин 291 кв. сажень (под постройками – 3 десятины 2080 кв. сажён, под садом возле кладбища – 1 десятина 395 кв. сажён, под лесом – 1893 кв. сажён, под кладбищем – 1 десятина 2 кв. сажени, под бульваром – 861 кв. сажень). На хуторе Березина – 74 десятины 793 кв. сажени (под постройками – 2 десятины 100 кв. сажён, пахотной земли – 58 десятин 1021 кв. сажень, лугов – 10 десятин 160 кв. сажён, под железной дорогой – 3 десятины 1155 кв. сажён, под дорогами – 457 сажён). На архиерейской даче «Лисица», расположенной на западе от Кременца, находилось 19,5 десятины, но использовалась только половина наделов. К Кременецкому в честь Богоявления монастырю были приписаны около 100 десятин земли упразднённой в 1797 г. православной Жидичинской архимандрии. Доходы обители составляли пожертвования, приходские деньги и выручка от продажи сельскохозяйственных продуктов (в 1936 г. в Кременецком в честь Богоявления монастыре доход составлял 4079, а расход – 4057 польских злотых). Количество братии не превышало 12–15 человек.