Создание «Книги степенной» исследователи датируют рубежом 1550 и 1560 гг., хотя замысел и, как полагают исследователи, подготовительные работы могли относиться к более раннему времени (по-видимому, к середине 1550 гг.), и соответственно хронологически «Книга степенная» вплотную примыкает к прочим крупным памятникам эпохи Московского митрополита Макария (1542–1563 гг.) – к Великим Минеям Четьим (Успенскому и Царскому комплектам) и «Летописцу начала царства». Представленная в научной литературе точка зрения о создании «Книги степенной» во второй половине 1560 гг. требует дополнительных аргументов. Как отмечено в первой главе первой степени, «Книга степенная» писалась «благословением и повелением» святителя Макария. Древнейшая редакция «Книги степенной» представлена тремя списками 1550–1560 гг., написанными, по мнению исследователей, в московском Чудовом в честь Чуда архангела Михаила в Хонех мужском монастыре: дошедшим во фрагментах Волковским списком (Российский государственный архив древних актов) и полными Томским и Чудовским (Томский областной краеведческий музей; Исторический музей). Несмотря на то что вопрос о характере взаимоотношений этих списков требует дальнейшего изучения, для исследователей очевидно, что они отразили процесс оформления текста памятника. По мнению исследователей, первоначально был сделан Волковский список в его сохранившейся части XVI в. (не раньше 1556 г.; раньше этого времени не могла быть создана вошедшая в «Книгу степенную» третья редакция Жития митрополита Ионы), которому могли предшествовать материалы подготовительного характера, затем с него был сделан Томский список, с которого, в свою очередь, была снята копия – Чудовский список (согласно Алексею Владимировичу Сиренову, его текст создавался с привлечением Волковского списка). Основной текст «Книги степенной» доведён до описания событий февраля 1560 г. – о многих важных событиях начиная с лета этого года (например, о смерти царицы Анастасии Романовны и втором браке Ивана IV) памятник умалчивает. Исследователи полагают, что основной текст «Книги степенной», включавший 1–17-ю степени, был создан к началу 1560 гг. Судя по всему, в начале 1563 г. в связи со взятием Полоцка (15 февраля) текст «Книги степенной» был дополнен рассказом о начале Ливонской войны (глава 18 17-й степени). На заключительном этапе редактирования «Книги степенной», не позднее 31 декабря 1563 г. (составитель «Книги степенной» не упоминает о смерти митрополита Макария), её текст в Волковском и Чудовском списках был дополнен пространной похвалой князю Владимиру (глава 72 первой степени), а в текст Чудовского списка была включена статья «Царские сановники». Составителем «Книги степенной» являлся протопоп кремлёвского Благовещенского собора, духовник царя Ивана IV Андрей (в иночестве Афанасий, в 1564–1566 гг. – Московский митрополит). На авторство Афанасия, переяславца по происхождению, указывает следующее: в «Книги степенной» помещён выполненный от первого лица рассказ об исцелении у гробницы великого князя святого Александра Ярославича Невского во владимирском в честь Рождества Пресвятой Богородицы мужском монастыре: имя исцелённого отсутствует в «Книги степенной», но есть в записи под 6999 г. в Шумиловском томе Лицевого летописного свода, что указывает на Афанасия («Полное собрание русских летописей», том 12).