По сохранившимся сведениям, в плане церковь была квадратной (примерно 17х17 м), имела ступенчатую крышу (по типу пагоды), увенчанную небольшой башней (возможно, колокольней). Внутри по всему периметру проходил амбулаторий. В храме было три алтаря: главный алтарь был посвящён Пресвятой Деве Марии, у восточного входа между двумя дверями находился алтарь преподобного Бенедикта Нурсийского, а в юго-восточном углу – алтарь св. Лаврентия. К церкви примыкал двухэтажный дом: на первом этаже располагались рефекторий и кухня, на втором – дормиторий, из которого по лестнице можно было попасть в церковь. Бернард Клервоский жил в тесной комнате над лестницей, где нельзя было выпрямиться в полный рост, креслом ему служил выступ в стене под скосом крыши. Монахи спали на дощатом полу, подстелив солому или сухие листья. Поскольку у Бернарда Клервоского было слабое здоровье, и при этом он часто находился в отъезде, монастырём фактически управляли его братья. В организации монашеской жизни помощь общине Клерво оказывали бенедиктинцы из соседнего приората Клеманпре (лат. Clementinum Pratum; ферма Морен аббатства св. Бенигна в Дижоне). В 1121 г. обитель получила привилегии от епископа Лангрского. Развитию Клерво способствовало благосклонное отношение со стороны крупных монастырей в регионе – аббатства Сент-Уайан-де-Жу (позднее Сен-Клод) и аббатства Клюни. Ещё при жизни Бернарда Клервоского у Клерво появилось несколько грангий (grangia, от лат. granum – зерно; букв. – «зернохранилище»), которые являлись основой системы организации сельского хозяйства, характерной для цистерцианского Ордена: на удалении от монастыря строились хранилища для собранной десятины и продукции монастырских угодий, загоны для скота; в грангиях работали, главным образом, конверсы (братья-миряне). Старейшая из грангий Клерво, существовавшая с момента основания монастыря, в источниках именуется Grangia abbatiae. Адон, аббат монастыря Сент-Уайан, в 1121 г. уступил Клерво часть десятины с грангии Фонтарс (современные коммуны Кёнфен и Рьель-лез-О). До 1122 г. Понс де Мельгей, аббат Клюни, передал Клерво грангию Фравиль (ныне на территории коммуны Арконвиль, в 5 км от Клерво) и освободил её от уплаты десятины; до настоящего времени там сохранились церковь и здание с кухней и дормиторием. Грангия Бомон была передана Клерво аббатом Ги Молемским с условием выплаты ренты. До 1147 г. у Клерво появилась грангия Утр-Об (ныне на территории коммуны Лоншан-сюр-Ожон). В 1125 г. щедрые пожертвования Клерво сделал Тибо IV, граф Блуа и Шампани, что позволило монахам и жителям региона пережить голод. В этот период аббатство кормило ежедневно до 2 тыс. нуждающихся. В 1131 г. Клерво посетил папа Римский Иннокентий II. Он был восхищён устройством аббатства и в 1132 г. освободил все цистерцианские монастыри от выплаты десятины, а также запретил другим епископам и аббатам переманивать братьев-мирян из Клерво (эта привилегия оставалась в силе до 1156 г.). Принято считать, что в декабре 1135 г. – феврале 1136 г. было решено перенести монастырь на новое место, ближе к реке. На пожертвования графа Тибо IV было начато строительство церкви, посвящённой Пресвятой Деве Марии.