В 1732 г. от имени академии Иоасаф приветствовал нового Киевского архиепископа Рафаила (Заборовского) поэмой собственного сочинения «Брань честных седьми добродетелей с седьми грехами смертными...». Поэма написана образным языком, в котором чувствуется влияние народной украинской речи. С 13 сентября 1734 г. принимал экзамены у будущих молодых священников перед посвящением их в сан. 8 ноября того же года в киевском Златоверхом во имя архангела Михаила монастыре архиепископом Рафаилом Иоасаф был рукоположён во иерея и 23 ноября переведён в киевский кафедральный Софийский собор; вскоре определён членом Киевской духовной консистории. В 1735–1737 гг. по поручению Киевского архиепископа Рафаила Иоасаф периодически совершал поездки по Малороссии, собирая пожертвования на академию. 24 июня 1737 г. Иоасаф был возведён в сан игумена и по настоянию архиепископа Рафаила вопреки собственному желанию назначен настоятелем Мгарского в честь Преображения Господня монастыря. 7 июля того же года прибыл на новое место служения. 10 сентября 1742 г. отправился в Москву и Санкт-Петербург для сбора средств на благоустройство обители, сильно пострадавшей при пожаре 1736 г. и не имевшей даже ограды. Иоасаф привлёк своих родственников, а через них и других состоятельных людей к оказанию материальной помощи монастырю. Вскоре был выстроен большой каменный братский корпус. 28 ноября 1742 г. в Москве в присутствии императрицы Елизаветы Петровны Иоасаф произнёс проповедь о любви к Богу и ближнему. В Санкт-Петербурге через знакомых представил свою сборную книгу императрице, и она распорядилась выдать 2 тыс. руб. на восстановление монастырского храма. 16 августа 1744 г. Иоасаф вернулся в обитель. Проявил себя как строгий постник, неутомимый молитвенник и деятельный восстановитель монастыря, при том что страдал от хронического заболевания (предположительно от туберкулёза). Судя по автобиографии Иоасафа («Путешествие в свете сем грешника Иоасафа, игумена Мгарского»), серьёзные обострения болезни относились к периодам с 16 августа 1737 г. по январь 1738 г., с 27 сентября 1740 г. по февраль 1741 г., с 4 апреля по конец мая 1746 г. В автобиографии Иоасаф также записал вещие сны, в которых ему являлся почитаемый им Афанасий III Пателларий, погребённый в Мгарском монастыре. В сентябре 1742 г. явившийся в тонком сне Киевский архиепископ Рафаил возвестил Иоасафа: «Будешь архимандритом». 10 января 1744 г. монастырская братия подала прошение митрополиту Рафаилу об учреждении в обители архимандрии и о возведении Иоасафа в сан архимандрита. Прошение подписали наместник обители иеромонах Наркисс, три иеросхимонаха, шесть иеромонахов, три иеродиакона, три монаха. 14 сентября того же года по указу императрицы Елизаветы Петровны в Киеве митрополит Рафаил возвёл Иоасафа в сан архимандрита.