Эта древнейшая на Афоне чудотворная икона входит в иконостас придела с правой стороны. Она выполнена из восковой мастики, черты лика размыты по причине истечения мира. Эту икону держал в руках Константинопольский патриарх Сергий I (610–638 гг.), обходя стены осаждённого персами и славянами Константинополя (626 г.). Заступничеством Пресвятой Богородицы неприятельский флот был рассеян штормом, и город спасён. Перед этой иконой впервые был совершён Акафист Пресвятой Богородице. Литургию в приделе служат ежедневно, по субботам её возглавляет игумен. На великие праздники икона крестным ходом переносится в кафоликон и ставится в киоте перед левой колонной. Серебряная позолоченная риза, согласно надписи на ней, изготовлена в 1786 г. На оборотной стороне серебряной ризы изображено вручение иконы преподобному Дионисию императором Трапезунда Алексеем III Комнином в 1374 г. С иконой связано много чудес. Похищенная пиратами (1592 г.), она была возвращена ими в монастырь после того как Пресвятая Богородица явилась в открытом море капитану корабля, на который обрушился шторм, и приказала вернуть Свою икону. Когда после прибытия в монастырь Дионисия был открыт ковчег, в котором лежала икона, он оказался наполненным благоухающим миром. Два пирата при виде чуда покаялись и стали монахами. Другое чудо произошло с начальником Афонской академии Евгением Вулгарисом (архиепископ Славянский и Херсонский при Екатерине II). Он подробно описал исцеление от опухоли в груди в 1758 г. от этой иконы. Фрески придела выполнены в 1890 г. Выше лити кафоликона находятся два придела. Придел св. Архангелов расписан монахами Меркурием и Германом в конце XVI – начале XVII в. Росписи и иконостас другого придела, освящённого во имя преподобного Дионисия, выполнены в XX в. Маленький храм св. Бессребреников расположен под кафоликоном в небольшой пещере и имеет выход к морю. Храм был построен в 1542 г., а фрески начала XVII в. были записаны во второй половине XIX в. Больничная церковь во имя апостола Иоанна Богослова построена в XVI в. Росписи относятся ко второй половине XVI – начала XVII вв. Нартекс расписан в 1615 г. Иконостас современен основанию храма. Самый маленький храм монастыря во имя Николая Чудотворца расположен на втором этаже звонницы. Его иконостас включает композицию над царскими вратами, изображающую виноградную лозу со вписанными в медальоны ликами Христа и 12 апостолов, а также иконы Спасителя и святителя Николая (обе XVII в.). Храм во имя Иоанна Златоуста на третьем этаже монастыря расписан сценами из его Жития. По надписи на иконе святителя (1695 г.) исследователи судят о времени постройки храма. На том же этаже расположен более просторный храм во имя святителя Нифонта. Судя по ктиторским надписям, он был построен скевофилаксом Вениамином в 1782 г., в нём сохранились написанные им иконы. С храмом Иоанна Златоуста сообщается храм Георгия Победоносца, расписанный монахом Даниилом в 1609 г., работавшим также над иконостасом и царскими вратами (всё убранство хорошо сохранилось). На третьем этаже северного крыла находится храм во имя Нектария Эгинского на месте прежнего храма Всех святых, от которого остались немногочисленные фрески в алтаре (Богородица Платитера с двумя иерархами).