30 ноября 1923 г. архиепископ Пётр (Полянский) был назначен настоятелем московского в честь Богоявления монастыря (Российский государственный исторический архив). Против повышения статуса владыки Петра (Полянского) выступили Московские викарии Феодор (Поздеевский), Борис (Рукин) и др. Неоднократно в конфликты с архиепископом Петром (Полянским) вступал и председатель Московского епархиального совета протоиерей Василий Петрович Виноградов, в начале 1925 г. митрополит Пётр (Полянский) пытался сместить его с должности. 24 января 1924 г. патриарх Тихон подписал указ, которым архиепископ Никандр (Феноменов) увольнялся на покой «из-за болезненного состояния», архиепископом Крутицким и управляющим Московской епархией назначался Пётр (Полянский). 22 марта 1924 г. патриарх наградил архиепископа Петра (Полянского) «в ознаменование прекращения Президиумом ВЦИК его следственного дела и за полезную службу Церкви Божией» саном митрополита (Российский государственный исторический архив). 12 апреля 1925 г., в день похорон патриарха Тихона, Крутицкий митрополит Пётр (Полянский) был объявлен присутствовавшими на похоронах архиереями патриаршим местоблюстителем с сохранением за ним звания управляющего Московской епархией. В декабре 1925 г. митрополит Пётр (Полянский) был арестован, после его высылки из Москвы, последовавшей 5 ноября 1926 г., Крутицкая кафедра не замещалась до 1944 г. В феврале 1926 г. Можайский епископ Борис (Рукин) заявил о своём вступлении в управление церквами Москвы и Московской епархии, ссылаясь на определение поместного Собора от 8 декабря 1917 г., по которому патриаршим наместником являлся Коломенско-Можайский архиерей, а не Крутицкий. В 1926 г. Московской епархией управлял Серпуховской епископ Алексий (Готовцев), его сменил в мае 1927 г. Звенигородский епископ Филипп (Гумилёвский). В 1934 г. в управление Московской епархией вступил митрополит Сергий (Страгородский), получивший титул «митрополит Московский и Коломенский». В 1920–1940 гг. действовала обновленческая Крутицкая кафедра, занимавший её «архиерей» был главой обновленческого Московского епархиального управления. 18 июня 1922 г. «Крутицким архиепископом» стал Леонид (Скобеев), 6 июля того же года он был переведён в Пензу. На его место назначили «архиепископа» Антонина (Грановского). 19 июля 1922 г. был утверждён новый состав Московского обновленческого епархиального управления под руководством Антонина (Грановского), за которым было закреплено руководство Московской епархией. Обновленческую Крутицкую кафедру также занимали Александр Иванович Введенский (1923–1924 гг.), Софроний Иванцов (1944–1946 гг.).