18 августа 1572 г. состоялась свадьба; в Париж на торжества прибыли видные представители гугенотского дворянства. В городе, большинство населения которого были католики, стали распространяться слухи о заговоре гугенотов и возможном нападении на короля. 22 августа Гаспар де Колиньи на пути из Лувра домой был ранен выстрелом из аркебузы в руку. Поскольку выстрел был сделан из окна дома, принадлежавшего герцогине Немурской Анне д'Эсте, вдове убитого при осаде Орлеана в 1563 г. герцога Франциска де Гиза, возникло предположение о причастности к покушению герцога Генриха де Гиза. Карл IX в сопровождении королевы-матери и придворных посетил раненого Гаспара де Колиньи и обещал ему поддержку, поиск виновных и судебное разбирательство. Однако, опасаясь недовольства гугенотов (по Парижу широко распространялись слухи о гугенотском заговоре, целью которого называли в том числе и убийство короля), заседавший 22 и 23 августа своеобразный «кризисный комитет» (король, Екатерина Медичи, герцог Генрих Анжуйский, Гаспар де Со, маршал де Таван, канцлер Рене де Бираг и ещё несколько вельмож), принял решение о нанесении превентивного удара – уничтожении собравшихся в Париже представителей кальвинистской аристократии (см. Варфоломеевская ночь). В ночь на 24 августа к дому Гаспара де Колиньи явились люди герцога Генриха де Гиза. Они смертельно ранили адмирала и ещё живого выбросили из окна на улицу; уже мёртвое тело протащили по всему городу, а затем повесили за ноги на виселице в Монфоконе. Только спустя некоторое время тело было тайно снято и похоронено по приказу кузена Гаспара де Колиньи герцога Франциска де Монморанси, бывшего губернатора Парижа (отказался от этой должности за несколько дней до Варфоломеевской ночи). В протестантской историографии и исторических исследованиях до конца XX в. ответственность за убийство Гаспара де Колиньи возлагалась как на Гизов, мстивших Гаспару де Колиньи, так и на Екатерину Медичи, которая была весьма обеспокоена растущим влиянием адмирала на короля; в настоящее время высказываются и другие предположения: покушение на Гаспара де Колиньи могло быть организовано агентами испанского короля Филиппа II, который был недоволен внешнеполитическими проектами адмирала, его мог совершить и одиночка – ревностный католик. В Варфоломеевскую ночь был убит и зять Гаспара де Колиньи Шарль де Телиньи. Овдовевшая дочь Гаспара де Колиньи Луиза (1555–1620 гг.) в 1583 г. вышла замуж за Вильгельма, принца Оранского-Нассауского, статхаудера Нидерландов. Их потомок Вильгельм III, принц Оранский, статхаудер Республики Соединённых провинций, в 1689 г. занял английский престол. Старший сын Гаспара де Колиньи Франсуа де Колиньи де Шатийон (1557–1591 гг.) после Варфоломеевской ночи бежал в Женеву, потом в Базель, в 1570–1580 гг., во время религиозных войн командовал войсками гугенотов. Следуя советам Франсуа де Шатийона, король Генрих Наваррский заключил союз (30 апреля 1589 г.) с французским королём Генрихом III, изгнанным из Парижа Католической лигой. Младший сын Гаспара де Колиньи Шарль, маркиз д'Андело (1562–1632 гг.), единственный из детей адмирала, кто был крещён и с детства воспитывался в протестантской вере, перешёл в католичество.