13 октября 1899 г. состоялась торжественная встреча архипастыря в кафедральном Петропавловском соборе (взорван в 1936 г.) духовенством во главе с протоиереем Георгием Иакинфовичем Тарнопольским (ум. в 1902 г.). 25 октября 1899 г. Михаил в присутствии губернатора Николая Николаевича Трубецкого освятил помещение второй, новой женской гимназии Министерства народного просвещения. В 1899 г. был капитально перестроен в русском стиле и 8 ноября Михаилом освящён собор минского в честь Преображения Господня женского монастыря. За время управления епархией Михаил освятил Кирилло-Мефодиевский храм (1899 г.) в местечке Погост-Загородский Пинского уезда, Троицкую церковь (1900 г.) в селе Березовце Новогрудского уезда, построенную «из колотого и обработанного камня», собор (1900 г.; после капитального ремонта) Ляданского в честь Благовещения Пресвятой Богородицы монастыря, Вознесенский храм (1904 г.; после перестройки) при Минском женском училище духовного ведомства, Георгиевскую гарнизонную церковь (1907 г.) в Бобруйске. В 1907 г. личный врач архиерея Иван Устинович Зданович, директор училища слепых и старший врач губернской земской больницы, устроил в здании училища домовую церковь в честь иконы Божьей Матери «Всех скорбящих Радость» (разобрана в 1929 г.). При Михаиле были построены и освящены церковь-школа в честь Рождества Иоанна Предтечи в деревне Малая Слепянка, приписанная к минскому Екатерининскому собору (в имении председателя правления Московско-Ярославско-Архангельской железной дороги Павла Сергеевича Хитрово; 1900 г.), храмы во имя великомученика Георгия Победоносца (1900 г.) в селе Брянчицы Слуцкого уезда, в селе Косаричи Бобруйского уезда (1900 г.), в деревне Замошье Бобруйского уезда (1901 г.), Николая Чудотворца (усыпальница князей Святополк-Мирских; 1904 г.; архитектор Роберт Робертович Марфельд) в местечке Мир Новогрудского уезда, в селе Червищи Пинского уезда, во имя Святой Троицы (1905 г.) в селе Демехи Речицкого уезда, Успения Пресвятой Богородицы (1905 г.) в селе Забелы Слуцкого уезда. К январю 1910 г. количество церквей епархии выросло до 1233 (десять соборов, семь монастырских, 547 приходских, 19 при казённых заведениях и домовых, 251 кладбищенская, 399 приписных), была открыта 101 часовня. К 1912 г. количество церквей в Минске выросло с 19 до 24. В епархии при Михаиле действовали шесть средних духовных учебных заведений: Минская духовная семинария, Минское, Пинское и Слуцкое мужские духовные училища, Минское и Паричское женские училища, в которых в начале ХХ в. насчитывалось от 104 до 224 учащихся. Осенью 1899 г. праздновался 50-летний юбилей Пинского духовного училища. 18 января 1904 г. началась деятельность братства Казанской иконы Божьей Матери при церкви Пинского духовного училища. Члены братства оказывали материальную помощь воспитанникам училища. В 1901 г. при Паричском училище по инициативе её начальницы выпускницы Смольного института Евгении Николаевной Бибиковой (урождённая Набокова; 1837–1902 гг.) была построена образцовая школа, в которой воспитанницы готовились к преподавательской деятельности. 8 февраля 1901 г. было открыто Общество вспомоществования нуждавшимся воспитанницам, девочкам из бедных семей.