Южный придел был освящён в честь Богоявления, северный – во имя святителя Алексия, митрополита Московского. Четыре фронтона собора украшены надписями из Священного Писания и мозаичными иконами. Ширинки заполнены майоликой. Внутри собор хорошо освещён и вместо колонн имеет четыре дугообразные перекрещивающиеся арки, удерживающие свод с куполом и центральный барабан. Храм отличался богатым внутренним убранством: иконы в золочёных киотах, три двухъярусных иконостаса. На солею, ограждённую коваными решётками, из приделов вели три мраморные лестницы. На перекрестиях арок свисали четыре бронзовых паникадила. Трёхъярусный резной иконостас в русском стиле XVII в., подаренный императором (1903 г., мастерская Петра Евстратовича Абросимова, художники М.М. Васильев, Фома Родионович Райлян), после закрытия собора (1936 г.) был перевезён в Ригу и установлен в соборе Рождества Христова, а в 1962 г. перенесён в Свято-Троицкий собор рижского Троице-Сергиева монастыря. Собор возвращён РПЦ в сентябре 1991 г., освящение центрального алтаря состоялось 20 июля 1997 г. 25 сентября 1898 г. императором Александром III в городе Батум был заложен собор во имя его небесного покровителя князя Александра Невского, в память 10-летнего окончания Русско-турецкой войны, в результате которой город был присоединён к Российской империи. Архитектором собора был В.А. Косяков, император внёс уточнения в проект. Собор был освящён 6 декабря 1906 г. и передан военному ведомству. Грандиозный храм называли «самым прекрасным зданием в Батуме», он доминировал в панораме города. В композиции пятиглавого собора выделялись массивная центральная луковичная глава и высокая шатровая колокольня, соединённая трапезной с основным объёмом. В основе плана лежал крест, боковые главы располагались крестообразно. С востока были пристроены полуциркульная в плане апсида и компартименты по её сторонам. Нижний ярус окружала галерея. Декор был выполнен в стиле русского коврового «узорочья» XVII в. Собор был закрыт в 1921 г. и в 1931 г. разрушен. Церковь Святой Троицы в селе (ныне деревня) Гора-Валдай (1899–1903 гг.) В.А. Косяков строил как усадебный храм Воронина. Закрытый в 1930 гг. и утративший внутреннее убранство храм восстанавливается с 1999 г. Прямоугольная в плане церковь завершена массивной луковичной главой и высокой шатровой колокольней над трапезной, отличается вертикалью композиции, наличием высокой центральной пятигранной апсиды и двух низких боковых компартиментов, квадратных в плане. Боковые фасады в три оси разделены лопатками, поля которых заполнены ширинками. Верхний ярус отделён профилированным антаблементом, членения завершаются полуциркульными кокошниками. Боковые крыльца, типичные для зданий, возводимых по проектам В.А. Косякова, завершены высокими щипцами. Барабан оформлен аркатурно-колончатым поясом, в его основании – пояс килевидных кокошников. В 1900–1906 гг. на средства рабочих и администрации санкт-петербургского Путиловского завода (проспект Стачек, 48) была построена церковь во имя Николая Чудотворца и царицы Александры (Путиловская) в память коронования государя. В.А. Косяков составил проект храма на 2,3 тыс. человек «в русском стиле, наподобие древнехристианских базилик».