При этом в докладе в ОГПУ от 30 июня о «разложении тихоновской церковной партии» В.Д. Красницкий выдвинул программу создания внутри церкви структур «Живой Церкви»: «Вместо органов управления, изображённых епархиальным управлением, связанных с синодом, – нужно противопоставить живую организацию, нужно возродить нашу группу со всеми групповыми епархиальными уездными и благочинническими комитетами и противопоставить тихоновским архиереям и благочинным – вообще всему их административному аппарату». В интервью, которые В.Д. Красницкий давал советской печати, он утверждал, что патриарх Тихон вошёл в общение с членами группы «Живая Церковь», фактически став на её путь борьбы с «церковной контрреволюцией». Также В.Д. Красницкий сообщал, что члены патриаршего синода якобы сами обратились к нему с приглашением о сотрудничестве, он же взял на себя ответственность вопреки постановлению обновленческого «Собора» 1923 г., в правильности которого по-прежнему не сомневался, признать патриарха Тихона главой церкви. Подобное поведение В.Д. Красницкого вызывало обеспокоенность у православного клира и мирян. После его высказываний в советских газетах, что патриарх ставит целью проведение программы группы «Живая Церковь», патриарх Тихон предложил Синоду все постановления по делу В.Д. Красницкого «считать не состоявшимися – аннулированными», поскольку была замечена неискренность в его намерении покаяния. В резолюции от 9 июля в адрес елисаветградского духовенства патриарх Тихон написал: «Я не пойду на соглашения и уступки, которые поведут к потере чистоты и крепости Православия. И если всякие толки и слухи о примирении, особенно в газетном изображении о. Красницкого и других, вместо радости возбуждают в сердцах верующих скорбь и тревогу, что подтверждается и многочисленными заявлениями архипастырей, пастырей и мирян, то, ввиду сего, почитаю благовременным прекратить всякие переговоры о примирении с о. Красницким и подписи на журнале от 8(21) мая 1924 г. об образовании при Мне Высшего Церковного Управления считать недействительными». При этом, не желая провоцировать прямой конфликт с советскими властями, патриархия избегала заявлений о разрыве с В.Д. Красницким, предпочитая объяснять неисполнение соглашения с ним техническими причинами (например, отсутствием помещения для заседаний ВЦС с участием «живоцерковников»). Сам В.Д. Красницкий некоторое время продолжал отрицать в печати «слухи о том, что между мною и патриархом Тихоном возникли недоразумения», однако 9 сентября, во время публичной лекции в Москве, был вынужден признать аннулированным соглашение между ним и патриархией от 21 мая. В.Д. Красницкого покинули большинство его бывших сторонников из «Живой Церкви». Он вернулся в Ленинград, возглавил остатки своей обновленческой группы. Служил в Князь-Владимирском соборе. В мае 1925 г. городские власти передали В.Д. Красницкому также Спасскую часовню при Гостином дворе. 8 ноября 1926 г. Князь-Владимирский собор был закрыт. Вместо него общине В.Д. Красницкого передали церковь во имя св. Иоанна Милостивого на Геслеровском проспекте. С 1927 г. В.Д. Красницкий служил также в церкви во имя Серафима Саровского на Серафимовском кладбище. В мае 1929 г. была закрыта часовня Христа Спасителя, а 10 октября того же года – храм св. Иоанна Милостивого. В.Д. Красницкий остался настоятелем единственного кладбищенского Серафимовского храма. В ноябре 1936 г. он тяжело заболел во время эпидемии гриппа. Скончался вне общения с православной церковью. Похоронен на Серафимовском кладбище вблизи храма.