В начале XIV в., согласно распоряжению папы Бонифация VIII, в ней должен был быть устроен странноприимный дом. В XV в. при храме некоторое время существовал женский бенедиктинский монастырь. В 1517 г. папа Лев X возвёл Сан-Чезарео-де-Аппия в ранг титульной церкви кардинала-пресвитера. При составлении документов в папской резиденции церковь была ошибочно названа церковью во дворце, что привело к дальнейшему отождествлению её с Сан-Чезарео-ин-Палатио. В 1587 г., при папе Сиксте V, титул церкви Сан-Чезарео-де-Аппия был упразднён, однако в 1600 г. папа Климент VIII утвердил её в статусе диаконии, которой она является и в настоящее время. В 1597–1603 гг. под наблюдением кардинала Цезаря Барония происходила реконструкция церкви «в раннехристианском стиле». После завершения реконструкции Сан-Чезарео-де-Аппия была передана конгрегации регулярных клириков Сомаски (1604 г.). В IX–X вв. Кесарию был посвящён один из монастырей, существовавших при базилике св. апостола Павла на Остийской дороге (Сан-Паоло-фуори-ле Мура). Впоследствии эта обитель была объединена с монастырём св. Стефана, а со второй половины IX в. получила название «монастырь св. апостола Павла». Также в Риме была церковь Сан-Чезарио-де-Аренула, основанная до 1063 г. С XII в. она находилась при храме Сан-Паоло-алла-Регола. В XVI–XVII вв. церковь была разобрана при строительстве храма и госпиталя Святой Троицы для паломников (Сантиссима-Тринита-деи Пеллегрини). Кесарий является покровителем Террачины, городской кафедральный собор посвящён этому святому. Сооружение собора на месте римского храма восходит к V или VI в., затем он несколько раз перестраивался. Согласно «Liber Pontificalis», папа Лев IV (847–855 гг.) передал дары этому храму. В 1074 г., после перестройки, собор был освящён епископом Амвросием в честь апостола Петра и Кесария. В 1088 г. здесь состоялось избрание Урбана II на Папский престол. Современная постройка сохранилась с различными изменениями XII–XVIII вв. Под алтарём собора находится частица мощей Кесария. Основная часть мощей Кесария и Иулиана хранится в главном алтаре базилики Санта-Кроче-ин-Джерузалемме в Риме. В 1070 г. папа Римский Александр II подарил часть мощей (руку) Кесария католическому св. Аннону II, архиепископу Кёльнскому, который поместил святыню в церкви св. Георгия в Кёльне. Другую часть мощей мученика понтифик подарил жителям Лукки. Впоследствии реликвия хранилась в монастыре св. Понтиана, в 2009 г. она была обнаружена в базилике св. Фридиана (Сан-Фредиано) в Лукке. 19 июня 2012 г. коммуна Чеза отпраздновала 400-летие со дня прибытия частицы руки Кесария. В ранних русских иконописных подлинниках описание изображения Кесария и Иулиана отсутствует. В «Руководстве к писанию икон» Виктора Дормедонтовича Фартусова сказано, что, поскольку на возраст мучеников нет никаких указаний, и Иулиана можно писать постарше, с проседью, с бородой средней величины, в фелони и епитрахили; Кесария следует изображать помоложе, с небольшой бородой, в стихаре и ораре.