Указом от 4 ноября 1911 г. Камчатская духовная миссия была учреждена в составе четырёх станов. Синод постановил организовать Камчатскую духовную миссию и распространить её деятельность на всю новообразованную Камчатскую область с каноническим подчинением её архиепископу Владивостокскому. Синод приказал увеличить содержание миссионерам до 1200 руб. в год и разъездные выплаты до 600 руб. в год. Иеромонах Нестор вновь был принят императором Николаем II, который назначил покровителем братства цесаревича Алексея Николаевича после достижении им семилетнего возраста. Император благосклонно отнёсся к проекту строительства в глухой части Камчатской области (селение Тиличики близ Гижиги, где было лишь восемь корякских юрт) церкви во имя Иоасафа Белгородского. Вернувшись на Камчатку, иеромонах Нестор приступил к созданию миссионерского Санкт-Петербургского стана в селении Тиличики, где были построены церковь во имя Иоасафа Белгородского и школа. Средства Камчатского братства шли на постройку в селениях церквей, школ, школы-приюта для детей кочующих оленеводов, на походные аптеки. На берегу моря, в Раковой бухте, в девяти верстах от Петропавловска, он создал колонию для больных проказой, устроив в этой колонии церковь во имя св. Иова Многострадального. В апреле 1912 г. иеромонах Нестор привёз на Камчатку миро и частицы мощей для новых церквей. В конце того же месяца архиепископ Евсевий ходатайствовал перед Синодом об утверждении начальником миссии иеромонаха Нестора, «как человека, вполне знакомого с Камчаткой и с положением миссионерского дела там и проявившего уже ревностное усердие в сём деле». 24 мая 1912 г. последовало утверждение этой кандидатуры Синодом. Так было положено начало возрождению Камчатской духовной миссии. Под миссионерское окормление иеромонаха Нестора передавалась обширная территория Камчатской области (за исключением Охотского уезда, территорию которого по определению Синода включили в состав Якутской викарной епархии). Иеромонах Нестор на территории благочиний, совпадающих с границами уездов, мог реализовывать свои планы миссионерской помощи, не испрашивая на то разрешения начальников уездов и благочинных, а только ставя их в известность. Светская власть и церковные иерархи на территориях, включённых в Камчатскую духовную миссию, обязывалась оказывать всяческое содействие миссионеру.