Большинство верующих также отнеслись к действиям митрополита Филарета крайне негативно. Практически во всех храмах Украины прекратилось поминовение предстоятеля УПЦ за богослужением. Наиболее резко отрицательное отношение к идее автокефалии Украинской церкви и личности Киевского митрополита выразила Одесская епархия. В Обращении к патриарху Алексию II выражалась просьба принять её в непосредственное патриаршее управление. 17 апреля 1992 г. патриарх Алексий II направил митрополиту Филарету письмо с нарочным, в котором просил Киевского митрополита сообщить, соответствует ли действительности распространённая через СМИ информация об изменении его решения оставить пост предстоятеля Украинской церкви. Письменного ответа Филарет не дал, от него также не последовало ответа на приглашение прибыть на заседание Священного Синода РПЦ, которое должно было состояться 6-7 мая 1992 г. 30 апреля 1992 г. в Житомире по инициативе Житомирского и Овручского архиепископа Иова (Тывонюка) состоялось собрание архиереев, духовенства, монашествующих, представителей православных братств и мирян УПЦ. Из числа архиереев помимо архиепископа Иова на собрании присутствовали: митрополит Агафангел (Саввин), епископы Кировоградский Василий (Васильцев), Черновицкий Онуфрий (Березовский), Тернопольский Сергий (Генсицкий), Донецкий Алипий (Погребняк). Заявление Киевского митрополита было подвергнуто участниками собрания острой критике, Филарет был обвинён в клевете на Архиерейский собор и в клятвопреступлении. Собрание потребовало от Киевского митрополита незамедлительной отставки. Участники собрания также заявили, что настаивают на проведении 11 мая 1992 г. Архиерейского собора УПЦ, с тем чтобы на нём принять отставку митрополита Филарета. Деятельность митрополита Филарета стала предметом обсуждения на расширенном заседании Священного Синода РПЦ 6-7 мая 1992 г. Филарет на заседание Синода не явился. Члены Синода решительно осудили его заявление по поводу московского Архиерейского собора как не соответствующее истине и вводящее в заблуждение паству. Синод квалифицировал слова Киевского митрополита как «хулу на соборный разум Церкви, действующий по водительству Святого Духа», и предписал митрополиту Филарету до 15 мая 1992 г. созвать Архиерейский собор УПЦ, подать на нём прошение об отставке с поста её предстоятеля. В связи с чрезвычайным положением, возникшим в УПЦ по вине её первоиерарха, Синод запретил митрополиту Филарету до Архиерейского собора УПЦ действовать в качестве её предстоятеля, а именно: созывать Синод, рукополагать архиереев, издавать указы и обращения. Исключением мог быть только Собор, на котором Филарет должен был подать в отставку. Решением Синода все прещения и наказания, которые уже были или могли быть наложены на архиереев, клириков и мирян митрополитом в связи с поддержкой ими постановлений Архиерейского собора РПЦ 31 марта – 5 апреля 1992 г., объявлялись незаконными и недействительными. Синод предупредил Филарета о том, что в случае неисполнения постановлений Собора и данного решения Синода он будет предан церковному суду.