Исследователи отмечают, что в настоящее время филологические взгляды, отражённые в этой и других работах Джеймса Кларка, являются во многом устаревшими и научного интереса не представляют. В 1860 гг. Джеймс Кларк нёс пресвитерское служение в различных приходах Церкви Англии, в том числе в Линдли, графство Йоркшир (1863–1865 гг.), в Саут-Шилдсе, графство Дарем (1865–1866 гг.), в Ротереме, графство Йоркшир (1866–1867 гг.). С 1869 по 1874 гг. Джеймс Кларк исполнял обязанности капеллана в англиканской церкви города Мемеля в Пруссии (ныне Клайпеда, Литва). Будучи европейским представителем Англиканского и международного общества изучения христианской морали (Anglican and International Christian Moral Science Association), Джеймс Кларк встречался и переписывался со многими германскими и датскими теологами. Особенно тесно он общался с известным немецким церковным историком, богословом и апологетом Отто Цёклером (1833–1906 гг.), который в ряде работ пытался продемонстрировать совместимость библейского откровения с данными естественных наук; влияние идей Отто Цёклера исследователи видят в последующих сочинениях Джеймса Кларка. После завершения служения в Пруссии Джеймс Кларк вернулся в Лондон, где в 1874–1875 гг. исполнял обязанности лектора Общества христианского свидетельства (Christian Evidence Society), целью которого было ведение рациональной полемики со сторонниками атеизма и позитивизма. В 1860–1870 гг. Джеймс Кларк сотрудничал с альманахом «Проповедник» («The Homilist»), который издавался приверженцем конгрегационализма проповедником Дэвидом Томасом (1813–1894 гг.). В этом альманахе публиковались, главным образом, гомилетические и экзегетические материалы, доступные широкой аудитории и лишённые духа межконфессиональной полемики. Статьи и заметки Джеймса Кларка выходили и в другой популярной религиозной периодике. В 1876 г. Джеймс Кларк был направлен для служения на остров Антигуа (ныне в составе государства Антигуа и Барбуда), который в то время был колониальным владением Великобритании. В 1885 г. получил почётную должность архидиакона Антигуа, с 1892 г. исполнял обязанности генерального викария англиканского диоцеза Вест-Индия. В 1885–1888 гг. Джеймс Кларк был членом редколлегии «Вест-Индского журнала» («The West Indian Quarterly»; всего выпушено три номера), где публиковались статьи религиозного, философского и культурологического содержания. Последним местом служения Джеймса Кларка был англиканский приход Сент-Филип на острове Антигуа, где он и скончался.