Исследователи отмечают, что характер отделки фасадов не типичен для церквей, а, скорее, свойствен светским зданиям: прямоугольные окна, размещённые по осям, создают равномерный, несколько однообразный ритм, на фасадах преобладают горизонтальные членения. Всё это (как и отсутствие колонн большого ордера) убеждает, что храм был задуман лишь как часть дворцового ансамбля, который не был осуществлён. Храм завершён световым барабаном с прорезанными прямоугольными окнами и силуэтно выделяющимися треугольными сандриками. Наверху установлена открытая декоративная круглая беседка-фонарик на колонках. В 1779–1780 гг. по заказу митрополита Платона (Левшина) М.Ф. Казаков пристроил к трапезной Алексиевской церкви Чудова монастыря новую паперть с крыльцом, выходившим на Ивановскую площадь (он вновь применил псевдоготическую стилистику, смешанную с русскими мотивами). Крупный прямоугольный двухэтажный объём трапезной с наличниками в формах, переходных от узорочья к нарышкинскому стилю, был дополнен монументальным трёхарочным крыльцом во всю высоту здания. Крыльцо, увенчанное двумя пирамидами наподобие парных колоколен, стало доминантой древнего ансамбля – и в то же время было ярким примером эклектизма. Двойные арки с гирьками опирались на мощные тосканские колонны с перехватами. Архивольты арок имели стрельчатые очертания. Был также использован мотив раковин Архангельского собора. При этом венчающие пирамиды украшали ложные окна в классицистических рамочных наличниках – детали, взятые из баженовского проекта храма-пирамиды. Как и прочие постройки Чудова монастыря, паперть не сохранилась. В конце 1770 гг. проводилась регулярная перепланировка городов. М.Ф. Казаков осматривал «ветхости» кремля в Коломне и составлял план города. Приписываемое ему авторство проектов псевдоготических стен и башен в монастырях Брусенском, Бобренёве и Старо-Голутвине не подтверждается. Около 1780 г. начались активные работы ещё над одним крупнейшим архитектурным проектом Москвы – зданием университета на Моховой. Первоначально проект разрабатывал В.И. Баженов. Но в начале 1780 гг. к работе был привлечён М.Ф. Казаков, очевидно, рекомендованный Прокофию Акинфиевичу Демидову, финансировавшему строительство. М.Ф. Казаков последовательно в течение четырёх лет создал три проекта здания; каждый проект отличался от предыдущего более простой композицией и декором фасадов и строгостью архитектурных форм. Строительство монументального трёхэтажного здания с восьмиколонным ионическим портиком и полукруглым актовым залом велось вплоть до 1793 г. В 1812 г. здание университета сгорело и было воссоздано Дементием Ивановичем Жилярди после 1817 г. в стиле ампир.