В соборе хранилась и икона «Знамение», которой в 1855 г. архиепископ Илиодор (Чистяков) благословлял курское ополчение во время Крымской войны 1853–1856 гг. С чудотворной Коренной иконой совершались крестные ходы в Коренную пустынь. Но время пребывания святыни в пустыни менялось: сначала – одна неделя, с 1765 г. по просьбе игумена Коренной обители Исаии этот срок был продлён до двух недель. В 1767 г. указом Священного Синода носить икону в Коренную пустынь запретили. В 1806 г. Высочайшим повелением было определено, чтобы икона находилась в Коренной пустыни с пятницы девятой седмицы после Пасхи до 12 сентября. В эти дни святыню переносили из Курска в Коренную пустынь и обратно торжественным крестным ходом, который, по воспоминаниям, растягивался на весь путь от Курского монастыря до Коренной пустыни – 27 вёрст. Среди других святынь и древностей к началу XX в. в Курском монастыре хранились: икона архангела Михаила, пожалованная войскам великим князем Михаилом Павловичем и переданная воинами в монастырь; золотая риза для Курской-Коренной иконы, «устроенная» в 1598 г. и пожалованная царём Фёдором Ивановичем; другая риза для иконы, выполненная в мастерской санкт-петербургского ювелира Барбе (стоимость 28 127 руб.); серебряное паникадило (больше четырёх пудов) с привесами, пожертвованное в 1700 г. А.И. Хлюстиным, и др. На монастырском дворе стоял медный литой колокол 1689 г. – дар царей Ивана и Петра Алексеевичей и царевны Софии. Колокол был снят с колокольни в 1860 г. вследствие трещины, поставлен в северо-восточной стороне ограды монастыря на пьедестале. 14 июня 1787 г. Курский монастырь посетила императрица Екатерина II, пожертвовавшая архимандриту Амвросию с братией 1 тыс. руб. Один из жителей Стрелецкой слободы поднёс императрице выведенные им самим яблоки. Назвав слобожанина «добрым крестьянином», государыня пожаловала ему 100 руб. С тех пор этот сорт яблок был известен под названием «добрый крестьянин» и широко распространён на территории Курского края. В 1859 г. Курский монастырь посетил император Александр II. 20 апреля 1893 г. в обители молился св. праведный Иоанн Кронштадтский (Сергиев), которому епископ Курский и Белгородский Иустин (Охотин) подарил икону «с изображением драгоценнейшей святыни Курской Знамения Божией Матери». На следующий день, в праздник Преполовения Пятидесятницы, после окончания литургии Кронштадтский пастырь совершил крестный ход для освящения воды на реку Тускарь, в котором участвовал губернатор граф Алексей Дмитриевич Милютин. 1 сентября 1902 г. Курский монастырь посетил император Николай II с семьёй, молился у Курского-Коренного образа, получил в дар от Курского епископа Лаврентия (Некрасова) две копии этой иконы. К 1913 г., когда отмечалось 300-летие основания обители, на добровольные пожертвования были отремонтированы Знаменский собор (в том числе купол алтаря заменён железобетонным) и другие постройки. В Курском монастыре настоятельствовали строители и игумены, с 1674 г. – архимандриты. Архимандрит Иов (Базилевич; ум. в 1776 г.) 31 октября 1770 г. был хиротонисан во епископа Переяславского и Бориспольского, архимандрит Аполлос (Терешкевич; ум. в 1817 г.) 14 октября 1813 г. – во епископа Слободско-Украинского и Харьковского.