В середине 1990 гг. на территории микрорайона ЦГЛ формировалась община верующих под руководством иерея Георгия Политова (впоследствии игумен Амвросий). В 1995 г., в праздник Вознесения Господня, священник Георгий с группой верующих посетил Успенскую церковь и св. источник и отслужил первый за многие годы молебен. 16 ноября епископ Тамбовский и Мичуринский Евгений (Ждан) обратился к мэру Мичуринска Николаю Михайловичу Антонову с письмом, в котором просил вернуть церкви сохранившиеся постройки обители. В апреле 1999 г. Тамбовской епархии в бессрочное пользование была передана Успенская церковь, в ноябре 2011 г. возвращены здания библиотеки и архиерейского корпуса (ранее – лабораторный корпус и школа №18), в 2012 г. – игуменского корпуса (школа №18). Но к марту 2014 г. значительная часть исторической территории Козловского монастыря оставалась в частной и федеральной собственности. 27 декабря 2007 г. решением Синода Козловский монастырь был возобновлён. 1 апреля 2012 г. за Божественной литургией в Успенском храме епископ Тамбовский и Мичуринский Феодосий утвердил игумена Амвросия настоятелем и вручил ему игуменский посох. В Успенском храме, после того как была смыта побелка с потолка, открылась настенная роспись. По правую сторону сохранились изображения Тихона Задонского, Митрофана Воронежского, праотца Иакова, пророков Иеремии, Даниила, Соломона, по левую – пророков Давида, Моисея, Гедеона и, предположительно Исаии, праведного Иосифа Обручника, мученика Феодора Черниговского, Иоасафа Белгородского. Над левым клиросом изображены преподобные Сергий и Герман Валаамские, над правым – преподобные Зосима и Савватий Соловецкие. Перед алтарём – большая икона Божьей Матери «Киево-Печерская» с предстоящими преподобными Антонием и Феодосием. В Козловском монастыре есть монастырский сад с плодовыми деревьями, на территории – хозяйственные постройки. Рядом с Успенской церковью на месте разорённого монастырского некрополя разбиты газоны, и посажены розы, в центре установлен символический памятник «Несение Креста». Ведётся восстановление монастырской стены и св. ворот. В Успенской церкви хранятся частицы мощей святителей Николая Чудотворца и Луки (Войно-Ясенецкого), главы св. Иоанна Крестителя, священномученика митрополита Киевского и Галицкого Владимира, великомученицы Варвары, священномученика Киприана и мученицы Иустины, блаженной Матроны Московской, преподобных Сергия Радонежского, Амвросия Оптинского, Кукши Одесского, праведного Софрония Ибердского, Киево-Печерских святых и др. Мощи основателя монастыря иеромонаха Иосифа Козловского, который почитается как подвижник благочестия Тамбовской епархии (память 9 сентября и 28 июля – в Соборе Тамбовских святых), не обретены. Среди святынь Козловского монастыря – иконы Божьей Матери «Казанская», «Тихвинская» и «Знамение», старца Иосифа. Особым почитанием в Козловском монастыре пользуются св. источник в честь Тихвинской иконы Божьей Матери и могила блаженного Иоанна Григорьева. Ежегодно 9 июля, в день празднования Тихвинской иконе Божьей Матери, совершается крестный ход на св. источник близ монастыря. К ноябрю 2014 г. в Козловском монастыре проживали несколько насельников; настоятель иеромонах Софроний (Есимов). Братия окормляла два прихода – во имя бессребреников Космы и Дамиана в селе Терновом и в честь Казанской иконы Божьей Матери в селе Стаеве (оба Мичуринского района Тамбовской области).