По свидетельствам очевидцев, Иоанн «служил весьма торжественно и благолепно. Величавая осанка в архиерейском облачении, мощный голос, с понижением при переходе к смиренной просьбе, наконец, произносимые трогательно и с большим чувством молитвы – всё это производило на молящихся неизгладимое впечатление, и они проникались глубоким молитвенным настроением». Иоанн был доступен для всех просителей, старался каждому оказать посильную помощь, вёл огромную переписку, всегда лично отвечал на все письма. За 1921–1924 гг. он провёл больше 400 богослужений, написал и произнёс больше 250 проповедей. Председательствовал на всех заседаниях Синода ЛПЦ и был его секретарём, лично вёл всю канцелярскую работу. До приезда Иоанна в Ригу существовали некоторые разногласия между латышскими и русскими приходами. Иоанн никогда не делил приходы по национальному признаку, понимал проблемы всех чад церкви. В 1923 г. на очередном Соборе ЛПЦ ему удалось устранить спровоцированное врагами церкви противопоставление православных русских латышам. Были приняты Устав Православной церкви в Латвии, ряд постановлений, упорядочивших хозяйственную и административную церковную жизнь, восстановивших работу церковных организаций и учреждений, которые ранее прекратили деятельность в связи с обстоятельствами военного времени. Собор заявил протест против бесправного положения Православной церкви в Латвии. Иоанну удалось остановить процесс изъятия у ЛПЦ недвижимого имущества. Он последовательно вёл работу по урегулированию взаимоотношений ЛПЦ и Латвийского государства, однако многочисленные прошения и переписка с государственными учреждениями не давали результата. Тогда Иоанн принял решение о выставлении своей кандидатуры на выборах в латвийский сейм (парламент) второго созыва. В 1925 г. при поддержке православных избирателей он был избран депутатом сейма. Аргументированные выступления Иоанна на заседаниях сейма побудили, наконец, Управление духовных дел принять к рассмотрению разработанный Иоанном и предложенный в 1922 г. Синодом законопроект о юридическом положении ЛПЦ. 8 октября 1926 г. сеймом был принят закон, дающий православной церкви юридический статус, права на самоуправление, владение имуществом, учреждение своих организаций, обществ и учебных заведений. 1 декабря 1926 г. была вновь открыта Рижская духовная семинария; начали действовать церковные школы. С 1921 по 1934 гг. в Латвии было построено и освящено 22 новых православных храма, во многих храмах проведены ремонтные и реставрационные работы, с 1926 г. на эти цели стали выделяться государственные субсидии. Православные священнослужители получили право на пенсии.