Адвентисты седьмого дня имеют в Астраханской области две общины, зарегистрированные в 1994 г., ведут энергичную прозелитическую деятельность. В Астраханской области активно действуют харизматические секты: миссия милосердия «Ковчег» (с 29 декабря 1992 г.), община церкви «Благодать» корейской миссии «Грейс» (с 23 мая 1994 г.), община Церкви Христа  (с 16 декабря 1994 г.) и три общины церкви «Полного Евангелия» (с 16 декабря 1994 г.). Церковь Христа в Астрахани сформировалась на базе молодёжного отделения, выделившегося из общины пятидесятников, при финансовой поддержке из-за рубежа и от московского центра «Россия – Иисусу». С 1997 г. астраханская Церковь Христа регулярно проводит масштабные акции (в том числе цикл проповедей на местном коммерческом телевидении). В 2001 г. руководители астраханских харизматических сект разработали проект создания союза, призванного объединить эти секты с некоторыми протестантскими деноминациями. В связи с необходимостью прохождения перерегистрации в органах юстиции, для чего требовалось подтвердить 15-летнее существование на территории области, харизматические религиозные объединения в 1998 г. вошли в астраханскую общину пятидесятников. Новоапостольская церковь имеет в Астраханской области общину (с 17 февраля 1993 г.), с 1997 г. активизировавшую свою деятельность в районах компактного проживания немцев Поволжья, что приводит к обострению отношений между Новоапостольской церковью и лютеранской общиной. В Астраханской области зарегистрировано объединение Свидетелей Иеговы (15 ноября 1993 г.), имеющее пять отделений в Астрахани и семь – в районах области. Свидетели Иеговы регулярно проводят и посещают областные и региональные конгрессы своей деноминации в Астрахани и Волгограде. В 1998–2000 гг. наблюдался рост численности свидетелей Иеговы в Астраханской области. Общество «Сознание Кришны» имеет в области общину (зарегистрирована 27 августа 1993 г.) и благотворительный центр «Пища для жизни». В 1997 г. центр астраханских кришнаитов переместился в район городских новостроек (ул. Бабаевского), одной из причин переезда было отсутствие в микрорайоне построек, принадлежащих другим конфессиям. В 1998 г. община претерпела ряд организационных изменений, были прекращены телепередачи, свёрнуты на некоторое время рекламные благотворительные акции и массовые выступления. С 1999 г. собрания кришнаитов происходят исключительно в домах единоверцев и не выходят на широкую общественность. 17 ноября 1995 г. управлением юстиции администрации Астраханской области зарегистрирован «Астраханский центр дианетики» (см. Саентология), с 1997 г. в Астраханской области также действует «Церковь саентологии» (не зарегистрирована). Общества «Шри-Чинмоя», «Центр Рерихов», «Агни-Йога» (см. «Живая этика») прошли государственную регистрацию в качестве общественных неполитических объединений. Регулярно проходят собрания «рериховцев», центр «Шри-Чинмоя» ежегодно проводит «Бег мира» и выставки. Эпизодически посещают регион проповедники «Церкви Объединения» (Сен Муна) и «Церкви Семья» (см. Дети Бога). В XVIII–XIX вв. в Астраханской области, преимущественно в Черноярском, Енотаевском и Церёвском уездах, существовали также общины молокан, субботников и странников-пещерокопателей (нестарообрядцев).