В 1928–1929 гг. в местной прессе публиковались резолюции собраний трудовых коллективов о закрытии храмов, сносе церквей или приспособлении их под жильё, столовые или клубы. Зачастую власти сначала обвиняли церковные общины в небрежном отношении к храмовым зданиям и имуществу, а после расторжения договора с общиной принимали решение о сносе храма. За лето 1928 г. в бывшей Владимирской губернии было закрыто 20 церквей, в 1918–1940 гг. – 330 храмов. После издания 16 декабря 1929 г. секретариатом ВЦИК постановления «Об урегулировании колокольного звона в церквах» во Владимирском крае началась активная «антиколокольная кампания». Территория Владимирской епархии в эти годы изменялась в соответствии с изменением административно-территориального деления края. 21 сентября 1917 г. из Владимирской губернии в Московскую были переданы село Орехово и местность Никольское Покровского уезда; в 1918 г. в новообразованную Иваново-Вознесенскую губернию были включены Шуйский уезд, отдельные волости Суздальского и Ковровского уездов, в связи с чем было учреждено Иваново-вознесенское викариатство Владимирской епархии, в 1920 г. преобразованное в Ивановскую епархию, к которой в 1921 г. из Владимирской епархии перешла северная часть Вязниковского уезда. В 1921–1922 гг. часть территории Владимирской губернии отошла Московской и Нижегородской губерниям. 14 января 1929 г. образовалась Ивановская промышленная область, состоявшая из бывших Иваново-Вознесенской, Владимирской и Костромской губерний. 14 августа 1944 г. была создана Владимирская область (в современных границах). 27 августа 1944 г. на Владимирскую кафедру был хиротонисан Онисим (Фестинатов), до 1946 г. управлявший также Ивановской епархией, с 25 февраля 1956 г. – в сане архиепископа. В 1952 г. во Владимирской епархии действовали 72 храма (8 городских, 64 сельских), в 1953 г. семь приходов закрылись (по сообщению архиерея в годовом отчёте, «за неимением кандидатов в священники»). В 1953 г. клир епархии составлял 71 священник и 17 диаконов. В 1954–1955 гг. число священнослужителей увеличилось до 93 человек, в 1956 г. оно составляло 97 человек, в 1957 г. – 101 человек (83 священника, 19 диаконов). В 1956 г. 52% клириков были в возрасте старше 60 лет. Остро стояла проблема низкого образовательного уровня духовенства, в 1953 г. в епархии не было ни одного священнослужителя с высшим богословским образованием, законченное среднее образование имели около половины иереев. В 1940–1950 гг. в сельских приходах была жива традиция хождения духовенства в престольные и двунадесятые праздники с молебнами по домам верующих. В 1958 г. возник конфликт с представителями местных органов власти из-за посещения священниками домов прихожан с молебнами в сёлах Тащилово и Палищи. В отчёте за 1956 г. епископ Онисим отметил увеличение числа верующих, среди них – молодёжи, увеличение числа крещений и христианских погребений по сравнению с предшествующими годами. В 1950–1954 гг. в Успенском соборе прошли реставрационные работы, 11 июня 1954 г. епископ Онисим освятил собор. В 1962–1964 гг. В.Е. Брагин и С.С. Чураков реставрировали в соборе фрески работы Андрея Рублёва. 4 октября 1957 г. праздновалось 800-летие храма.