В большинстве губерний, находившихся тогда под контролем советских властей, к введению новых порядков в конфессиональной сфере приступили только в первые месяцы 1919 г. Так, например, в Тверской губернии весь 1918 г. вероисповедный подотдел при отделе управления губисполкома «не проявлял никакой деятельности». В конце 1918 г. подотдел был упразднён, а его дела переданы в губотдел юстиции. 19 февраля 1919 г. Тверской губисполком утвердил постановление об обязательном исполнении декрета «Об отделении церкви от государства и школы от церкви», после чего в губернии, согласно отчётам, «начинается планомерное проведение декрета в жизнь». Однако, как сообщалось, «волостные и городские исполкомы..., несмотря на неоднократные напоминания и угрозы репрессиями за неисполнение декрета, проявили крайнюю инертность, небрежность, а подчас и преступную халатность. Немногие из исполкомов прислали в губотдел юстиции документы в полном порядке, как то требовалось обязательным постановлением губисполкома». В Новгородской губернии местный ликвидационный отдел начал работу только с конца 1918 г., а в январе 1919 г. разослал по уездным и волостным исполкомам собственную инструкцию о регистрации религиозных общин. Однако до осени того же года договоры с церковными общинами и описи имущества церквей в Новгород с мест так и не поступили; губотдел 6 ноября 1919 г. констатировал, что «проведение в жизнь Декрета об отделении Церкви от государства в уездах стоит бесподвижно на одном месте». Видя, что ликвидационный губотдел не справляется с порученной ему миссией, Новгородский губком РКП(б) обратился за помощью в центральный VIII отдел, который в мае 1920 г. направил в Новгород своего сотрудника Н.Н. Левендаля, назначенного временно исполняющим должность заведующего церковным подотделом при губотделе юстиции. Благодаря его энергичным действиям к началу 1920 г. в Новгород стали поступать договоры с религиозными общинами о пользовании храмами. Одновременно Н.Н. Левендаль занимался закрытием домовых церквей и монастырей, изымал церковные здания для размещения в них советских учреждений. Однако в отдалённых частях Новгородской губернии реализация декрета «Об отделении церкви от государства и школы от церкви» затянулась до осени 1920 г. В Ярославской губернии ликвидационная комиссия церковных и монастырских имуществ до весны 1919 г. работала «крайне вяло», к тому же без достаточных оснований конфликтовала с уездными органами власти, в результате сообщалось, что декрет «Об отделении церкви от государства и школы от церкви» «почти не проводится в жизнь». По требованию VIII отдела Ярославский губисполком обновил состав губкомиссии, после чего «работа по отделению церкви от государства в пределах Ярославской губернии сделалась более продуктивной». Самой показательной ситуация с неисполнением декрета «Об отделении церкви от государства и шаоклы от церкви» оказалась в Тульской губернии, которая в отчётах VIII отдела значилась как «особо отсталая». При Тульском губисполкоме так и не был образован орган для проведения религиозной политики. Ни в одном из уездов опись церковного имущества до конца гражданской войны так и не была проведена. Руководство VIII отдела связывало такое положение с большим влиянием в Тульской губернии «клерикальных элементов», однако, скорее, это было проявлением отношения местных властей к вопросам религиозной политики как к менее важным на фоне других проблем.